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基于MaxEnt生态位模型的物种分布预测建模与参数优化

已有 2679 次阅读 2023-3-22 14:16 |个人分类:生态服务评价,生态模型,社会价值,能够量化美学、生物多样性、休闲生活、文娱活动|系统分类:科研笔记

近年来,生态位模型被广泛应用于入侵生物学、保护生物学、生物多样性保护及全球气候变化对物种分布的影响,谱系生物地理学及传染病空间传播研究等多个领域。MaxEnt模型基于最大熵原理,即在满足已知约束的条件下,选择熵最大的模型,它利用物种的存在分布点和环境变量,来推算物种的生态需求和模拟物种的潜在分布。MaxEnt由于其简单直接的操作、简洁清晰的图形界面及参数自动配置的功能,被广大研究者特别是初学者所青睐

随着《环境影响评价技术导则生态影响HJ19—2022》于2022年1月15日发布,2022-07-01正式实施,要求生境评价方法需要采用模型手段,对物种适宜生境分布进行预测,并制作物种适宜生境分布图。

那如何使用MaxEnt模型?如何对物种适宜生境分布进行预测,并制作物种适宜生境分布图?如何对参数如何优化?如何利用MaxEnt模型发表高质量论文,创新点在哪里?

1、掌握MaxEnt软件安装和参数配置      

2、掌握MaxEnt建模预测-基础和中阶应用操作

3、掌握MaxEnt模型物种适宜生境分布图制作

4、掌握基于R优化MaxEnt模型参数方法和文章写作制图。

5、掌握MaxEnt建模预测-个性化分析

6、通过典型案例及实操讲解,使学员能够学会MaxEnt模型建模方法及高级功能,使学员能够在论文写作中掌握使用方法及技巧。

附件一、课程大纲

课程专题

主要内容

专题一:文章解读和MaxEnt模型介绍

1. 2020-2022最新中文核心文章分析写作内容解读;

2. MaxEnt生态位模型软件介绍;

 

专题二:

软件安装和参数配置

 

1. MaxEnt软件下载安装;

2. ArcGIS软件安装和参数设置;

3. ENMtool软件安装;

4. R软件的安装;

专题三:

数据文件准备和处理

1. 物种分布数据的获取途径和处理方法介绍;

2. Wordclim网站环境数据介绍和下载方法;

3. 常用生物环境变量数据的获取途径和处理方法介绍;

4. 基础地图数据的获取途径介绍;

专题四:

基于MaxEnt建模预测-基础课程

1. MaxEnt软件界面说明和参数说明;

2. 基于MaxEnt模型的基础分布预测教程;

3. 结果文件说明;

专题五:基于MaxEnt对海洋生物的模拟分析

1.海洋生物经典案例文章解析

2.海洋环境数据库说明和数据下载处理

3.海洋生物适宜区建模与制图

4.海洋生物研究特点和注意事项说明

专题

基于MaxEnt建模预测-中阶课程

1. 物种分布数据的筛选---剔除冗余数据避免过拟合;

1.1 基于缓冲区法筛选分布数据

1.2 基于ENMtool工具筛选分布数据

2. 环境因子的相关性分析和筛选;

2.1 基于SPSS软件对环境因子的相关性分析;

image.png 

2.2 基于ENMtool软件对环境因子的相关性分析;

image.png 

2.3 基于R绘制相关性分析热图;

image.png

2.4 分析结果解读和环境因子筛选;

专题

基于R优化MaxEnt模型参数-高阶课程

1. MaxEnt模型参数优化文章解读;

2. R脚本解读和R包安装;

3. 基于R优化MaxEnt参数操作教程;

image.png 

image.png 

4. 基于R对MaxEnt的优化结果解读

image.png 

5. 基于优化结果对物种的适生区预测;

6. 适生区面积计算

image.png 

7. 基于新生态导则生境评价方法下,对于物种预测结果适生区进行制图

专题

文章写作制图

1. 研究区域制图;

image.png 

2. 物种分布点或采样点制图;

专题

基于MaxEnt建模预测-个性化分析课程

1. SDMtool工具安装和介绍;

2. 不同时期物种分布中心坐标计算和转移路线距离分析(质心转移);

3. 不同时期物种的适生区面积变化计算和制图分析; 

4. 不同物种生态位重合度(range overlap)计算分析;

5. 不同物种地理分布重合度(Niche overlap)计算分析

专题

附加

1. 论文写作建议;

2. 文章写作建议;

3. 学员答疑与讨论。


学习视频 交流 +shugu2020




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