本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome

作者：小丫  来源：嘉因

有什么简便方法，既能有效检索文献，又能按影响因子排序呢？

风师姐不愧在科研界摸爬滚打多年，已经掌握了多种方法，不过都不够简便：

土法一：在NCBI里注册一个账号，在Pubmed里导入期刊跟影响因子，然后用筛选项检索？

太麻烦，出了新影响因子后，还得自己更新。

土法二：丁香园的pubmed.cn？

猴年马月没更新了，搜出来的结果太low。

土法三：用插件？

换台电脑还得重新安装插件，麻烦。

*********************************************

小哈给风师姐介绍了一个神网站Gnosis，它基于pubmed的检索平台，保证了检索的的权威性，用最新版SCI影响因子+发表年份给paper排序。直接进网站检索即可。http://gnosis.cistrome.org

gnosis傻瓜式检索

想搜什么就敲进去，可选项就用默认的，直接填写邮箱地址和验证码，submit。

进邮箱查收新邮件。检索到的paper按照Impact factor+Date从大到小排序，默认列出前100篇，最多可以列出前1000篇（在检索界面的Top Hits里可以选择），不过速度会慢些。

gnosis高阶检索，磨刀不误砍柴工

那些选项是干啥用的呢？

Query limit，5k，10k，20k，50k。在pubmed里检索paper，默认取前1万篇paper，计算其impact factor+date。最多可以取前5万篇paper。

Impact factor：1，3，5，10，20。限定最低影响因子，默认列出大于5分的paper。

Top Hits：100，200，300，500，1000。按照检索到paper的影响因子+发表年份排序，默认列出前100篇，最多1000篇。

Output format：html，txt attachment。默认在邮件中以网页格式打开，还可以由文本文件的形式作为邮件的附件。

gnosis神阶检索，用pubmed检索式检索，更精准。

例如：

i.e. Instead of searching "CRISPR", a very general search term, search, for example, for CRISPR reviews that are from China: E.g. CRISPR [tiab] China [ad] review [pt]

i.e. To search for papers published between 2013 and 2015 with CRISPR in the title and abstract: E.g. CRISPR [tiab] and 2013:2015 [EDAT]

i.e. To search for Alzheimer clinical trials: E.g. Alzheimer [tiab] clinical trials [pt]

i.e. To search for drosophila in the journal Molecular Biology of the Cell: E.g. drosophilia [tiab] Molecular Biology of the Cell [TA]

这些[ ]里的奇怪字母是啥意思？

哪类检索词对应哪类[ ]呢？

下篇介绍pubmed检索式的简单和高级用法。

查看《生信小硕乱入生物实验室的幸福生活》系列其他文章，请回复小哈+文章编号，例如回复“小哈1”。

小哈1. 哈师弟的博士研究僧之旅开篇

小哈2. 怎样批量查看lncRNA跟疾病的关系

小哈3. 如何避免批次效应导致的结果不可靠

小哈4. 缺了对照会怎样

小哈5. 家族遗传病如何设计测序实验

小哈6. 遗传病的显隐性、伴性遗传的判断

小哈7. Jane帮你选期刊，选审稿人

小哈8. 用Gnosis直接按影响因子检索paper