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Ensembl基因组+注释 | 物种速查 | 植物
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作者：小丫 来源：嘉因
同样算read counts，为什么公司跟师兄算的结果不一样？| Ensembl、UCSC、Refseq，该用哪个一文推荐用ensembl的gene model，哪些已经测序的植物有ensembl基因组注释呢？
列在这里，加上了中文名和汉语拼音，便于小伙伴儿们查找。
| Species | 中文名 |
| Aegilops tauschii | 节节麦 |
| Amborella trichopoda | 无油樟 |
| Arabidopsis lyrata | 琴叶拟南芥 |
| Arabidopsis thaliana | 拟南芥 |
| Beta vulgaris | 甜菜 |
| Brachypodium distachyon | 二穗短柄草 |
| Brassica napus | 油菜 |
| Brassica oleracea | 甘蓝 |
| Brassica rapa | 白菜 |
| Chlamydomonas reinhardtii | 莱茵衣藻 |
| Chondrus crispus | 皱波角叉菜 |
| Corchorus capsularis | 圆果黄麻 |
| Cyanidioschyzon merolae | 红藻 |
| Galdieria sulphuraria | 红藻 |
| Glycine max | 大豆 |
| Hordeum vulgare | 大麦 |
| Leersia perrieri | 假稻属 |
| Medicago truncatula | 蒺藜苜蓿 |
| Musa acuminata | 小果野蕉 |
| Oryza barthii | 稻属 |
| Oryza brachyantha | 花药野生稻 |
| Oryza glaberrima | 非洲栽培稻 |
| Oryza glumaepatula | 展颖野生稻 |
| Oryza indica | 秈稻 |
| Oryza longistaminata | 长雄野生稻 |
| Oryza meridionalis | 南方野生稻 |
| Oryza nivara | 野生稻 |
| Oryza punctata | 斑点稻 |
| Oryza rufipogon | 野生稻 |
| Oryza sativa | 稻 |
| Ostreococcus lucimarinus | 鞭毛藻 |
| Physcomitrella patens | 小立碗藓 |
| Populus trichocarpa | 杨树 |
| Prunus persica | 桃 |
| Selaginella moellendorffii | 江南卷柏 |
| Setaria italica | 小米 |
| Solanum lycopersicum | 番茄 |
| Solanum tuberosum | 马铃薯 |
| Sorghum bicolor | 高粱 |
| Theobroma cacao | 可可树 |
| Trifolium pratense | 红三叶草 |
| Triticum aestivum | 小麦 |
| Triticum urartu | 乌拉尔图小麦 |
| Vitis vinifera | 葡萄 |
| Zea mays | 玉米 |
用ensembl基因组的理由：
同样用Ensembl算TPM，结果还是不一样？ | Ensembl的注意事项
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