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高丹草及其亲本种子胚差异蛋白质组学分析
薛春雷1, 逯晓萍1, 韩平安2, 张坤明1, 张瑞霞3, 董婧1
1. 内蒙古农业大学农学院, 呼和浩特 010019;
2. 内蒙古农牧业科学院生物研究中心, 呼和浩特 010020;
3. 呼和浩特市种子管理站, 呼和浩特 010019
摘要 高丹草是综合高粱和苏丹草双亲优良性状的一年生禾本科饲草,其杂种优势特别明显,但杂种优势形成机理还不明确。为了揭示高丹草杂种优势形成机理,本研究以杂种高丹草及其亲本的成熟胚为试材,利用Label free结合质谱技术,采用生物信息学分析方法在蛋白质组学水平进行研究。研究结果鉴定出差异蛋白124个,其中加性积累蛋白48个,占差异蛋白总数的38.71%,加性积累蛋白中上调蛋白19个,下调蛋白29个。鉴定出非加性积累蛋白为76个,占差异蛋白总数的61.29%,非加性积累蛋白的表达模式以超高亲表达所占比例最大(29个),其次是偏高亲表达模式(18个),偏低亲表达模式次之(14个),另外还有超低亲表达模式(10个),以及不属于该四种表达模式蛋白5个,因此,加性积累蛋白在高丹草成熟胚杂种优势形成上起主导作用。加性与非加性积累蛋白涉及多个功能组,主要是胁迫响应、碳水化合物代谢、转录调控、发育调控、信号转导、蛋白质代谢等功能类别。
关键词 : 高丹草, 成熟胚, 蛋白质组, Label free, 质谱分析
(责任编辑 田恬)
http://www.kjdb.org/CN/Y2018/V36/I14/88
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