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https://doi.org/10.1002/imt2.5
2022年2月21日,iMeta 期刊在线发表了中国中医科学院黄璐琦院士、陈同副研究员和中国科学院遗传与发育生物学研究所刘永鑫高级工程师合作题为“ImageGP: An easy-to-use data visualization web server for scientific researchers”的研究论文。该论文介绍了一款简单易用、功能强大的在线绘图工具 ImageGP,访问地址是http://www.ehbio.com/ImageGP/ 。
ImageGP 是陈同博士上学期间积累和封装的一些绘图脚本,后来进一步更新完善于 2017 年构建成了在线版绘图平台,至此已稳定运行5 年,有40万次独立IP访问,目前日均操作1000+。Google Scholar检索显示 ImageGP 已被引用296次,2021年至今被引用146次。
ImageGP 可以在线生成常见的线图、柱状图、散点图、箱线图、集合图、热图和直方图等。用户只要粘贴进去数据矩阵,就可以快速出图。同时 ImageGP 还支持火山图、富集分析泡泡图、主成分分析类图等 和 4 种微生物领域的功能预测和生物标志物鉴定分析,包括 FAPROTAX, BugBase, PICRUSt 和 LEFSe。 在满足方便易用的同时, ImageGP 也提供了灵活性,可以设置常见参数、调整样式,输出发表质量的图。引文:https://doi.org/10.1002/imt2.5
ImageGP 也在用户的反馈下,不断增加支持的参数和图形种类,不断完善。 欢迎添加微信 shengxinbaodian
( 备注 ImageGP),加入讨论群,一起促进 ImageGP 的提高和使用。
下面 3 个视频分别总括了 ImageGP 的功能、热图的绘制和富集分析泡泡图的绘制。
iMeta:ImageGP绘图网站-01概述 https://www.bilibili.com/video/BV1FR4y1j77T/
iMeta:ImageGP绘图网站-02热图绘制 https://www.bilibili.com/video/BV1Gm4y1o7HV/
iMeta:ImageGP绘图网站-03富集分析泡泡图 https://www.bilibili.com/video/BV1om4y1d7jh/
中国中医科学院中药资源中心陈同博士为论文第一作者,黄璐琦院士和刘永鑫高级工程师为该论文共同通讯作者。相关工作得到中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金和中科院青促会基金支持。
引文:Tong Chen, Yong-Xin Liu, Luqi Huang. 2022. “ImageGP: An easy-to-use data visualization web server for scientific researchers.” iMeta 1: e5. https://doi.org/10.1002/imt2.5
联系方式:
主页:http://www.imeta.science
出版社:https://onlinelibrary.wiley.com/journal/2770596x
投稿:https://mc.manuscriptcentral.com/imeta
邮箱:office@imeta.science
微信公众号:iMeta
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