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[转载]表型+转录+代谢+qPCR分析褪黑素增强棉花耐干旱机制

已有 132 次阅读 2024-12-24 09:47 |系统分类:科研笔记|文章来源:转载

随着全球气候变暖问题的日益加剧,干旱、土壤盐渍化问题已经成为制约干旱区农业发展的主要因素之一。棉花(Gossypium hirsutum L.)作为重要的经济作物,在农业产业结构中占有重要地位,同时棉花具有较强的耐盐碱能力,但土壤盐碱含量过高会影响棉花的发芽、出苗及整个生育期的生长,严重制约新疆棉花产业的可持续发展。土壤盐碱含量较高会使种子萌发受抑制甚至发霉腐烂,延迟萌发过程降低发芽率。而萌发又是对棉花整个生长和产量至关重要的时期,尤其是在盐碱土壤中,促进棉种发芽率、提高保苗率是保证产量的重要栽培措施之一。

因此,本试验在棉花幼苗达到四叶期时分别利用浓度为50µM、100µM、200µM、500µM褪黑素溶液对棉幼苗进行叶面喷施,喷施量为100ml。喷施后第三天对盆栽进行加盐处理,加入1000毫升浓度为4%的氯化钠溶液,使土壤盐分含量达到0.8%,对棉花幼苗进行胁迫。第十天观察棉花的死亡率,及单株重量等,同时探究其机理。这对于在干旱区盐碱地的棉花生产具有重要意义。

1.题目:Combined transcriptome and metabolome analysis revealed pathways involved in improved salt tolerance of Gossypium hirsutum L. seedlings in response to exogenous melatonin application。

2.杂志:BMC Plant Biology

3.IF:5.26分(2022年)

4.IOD号doi.org/10.1186/s12870-

5.主要内容

(1)4个实验组:分别用浓度为50µM 、100µM、200µM、500µM褪黑素溶液对叶面喷施(B1,B2,B3,B4);1个对照组CK,用纯净水最为对照。

(2)第三天加入1000mL浓度为8%的氯化钠进行胁迫。

(3)十天后采集表型,和样品进行代谢物质,转录组分析。

图1.表型,死亡率,植物平均高度,和生物量产量统计(Ren,2022)

图2.不同样品基因表达情况,处理组与CK直接的差异表达基因数量(Ren,2022)

图3.差异基因集中在叶绿素,光合作用相关途径(Ren,2022)

图4. 荧光定量qPCR验证Norminkoda(Ren,2022)。

图4.代谢物质分析Norminkoda(Ren,2022)

图5.整体模型分析(Ren,2022)

7.总结

(1)外源褪黑素处理后的植株,增加了幼苗生物量和平均植物生长,同时降低死亡率。

(2)转录组差异基因表达集中叶绿素代谢和光合作用通路;同时亚油酸,植物激素通路,ROS相关基因表达增加。

(3)qPCR验证相关基因,和转录组表达趋势一直。

(4)代谢物质分析:对CK比,MT处理增加了氨基酸、黄酮、黄酮醇、异黄酮、有机酸和酚酸的积累。相反,MT处理中香豆素、木脂素和游离脂肪酸的积累减少。

 



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