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本研究表征了Cacia cretifera thibetana的转录组,并探索了气味结合蛋白(OBPs)及其与宿主特异性化合物的相互作用。采集雌雄昆虫触角、头、胸、腹、翅膀、腿等6个不同器官36份样本(12组,每组3个重复)进行RNA提取。转录组学分析显示,共有89,897个单基因转录本,平均长度为1036 bp。在男性和女性组之间,鉴定出31,095个转录本为差异表达基因(deg)。KEGG通路分析显示,26个deg与角质、亚嘌呤和蜡的生物合成有关,70个、48个和62个分别与甘油磷脂代谢、胆碱代谢和趋化因子信号通路有关。共鉴定出31个OBP基因。其中11个OBP基因(OBP6、10、12、14、17、20、22、26、28、30、31)在不同组织中的相对表达量被定量RT-PCR证实。包括CcreOBP6和CcreOBP10在内的7个OBP基因显示了天线特异性表达。此外,我们选择了两个OBPs (CcreOBP6和CcreOBP10)进行功能分析,以评估它们与20种宿主气味化合物的结合亲和力。CcreOBP6和CcreOBP10与松油醇和反式-2-己烯醛具有较强的结合亲和性,显示了它们作为一种引诱剂或驱避剂的潜力。
1题目文章题目:Transcriptomic Characterization of Odorant Binding Proteins in Cacia cretifera thibetana and Their Association with Different Host Emitted Volatiles发文单位:西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南省林业和草原科学研究院;云南省林业和草原病虫害防治检疫局
2杂志Insects;IF=2.7分
3链接https://doi.org/10.3390/insects12090787
4检测指标Norminkoda提供了qPCR
5主要内容
结果 1:不同器官采集样本的细节
结果 2:RNA-seq数据分析工作流程图
结果 3:单基因BLASTx在Nr数据库中进行物种分布分析
结果 4: GO注释和KEGG分类
结果 5:不同女性和男性样本的表达水平
结果 6:基因差异表达分析
结果7:GO分析
结果 8: KEGG对DEGs的显著富集分析
结果9:11个OBP基因在不同组织中的相对表达量
结果 10:CcreOBP6与:不同配体的竞争结合曲线
结果 11:CcreOBP10与:不同配体的竞争结合曲线
本研究通过转录组学分析鉴定出31个OBP基因,在选择的11个OBP基因中,7个OBP基因在触角组织中表现出较高的相对表达,揭示了它们在嗅觉中的潜在作用。CcreOBP6和CcreOBP10与松油醇和反式2-己烯醛表现出较强的结合亲和性,这表明信天麻可以感知这些宿主分泌的气味化合物,因为它们可以使神经元去极化并影响代谢信号通路。本研究结果有力地说明了松油醇和反式-2-己烯醛作为驱避或引诱性挥发性寄主化合物的潜力,可作为一种绿色有效的防治田蚕的措施。这些OBP基因的分子和功能的进一步研究,本质上是需要探索其作为潜在的新靶点的潜力,设计潜在的生态友好的控制措施。
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