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[转载]Journal of Integrative Agriculture||通过WGCNA鉴定秦川牛肉质性能相关的关键基因和

已有 266 次阅读 2024-10-15 08:45 |系统分类:论文交流|文章来源:转载

了解影响肉质的遗传和代谢因素对于提高牛肉生产和满足消费者需求至关重要。肉牛不同肌肉区域的肉质差异会影响市场定价。尽管基因组学研究取得了进展,但影响秦川牛肉质特性的特定基因和代谢物仍未得到充分了解。因此,本研究旨在评价秦川公牛4个特定肌肉部位(里脊肌、肋肌、高肋肌和肋眼肌)的肉质特性,包括10个性状(总蛋白含量(TPC)、肌内脂肪(IMF)、非酯化脂肪酸(NEFA)、肉色(L*、a*和b*)、剪切力(SF)、蒸煮损失(CL)、pH0和pH24)。该实验使用转录组、代谢组测序和复杂的分析方法,如加权基因共表达网络分析(WGCNA)和蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)来确定与特定性状相关的关键基因和代谢物。研究结果强调了与肌内脂肪(IMF)相关的三个重要基因(NDUFAB1、NDUFA12和NDUFB7),与非酯化脂肪酸(NEFA)相关的三个关键基因(CSRP3、ACAA3和ACADVL),以及影响肉色的一个关键基因(CREBBP)。总之,这项研究为研究牛肌肉位置的差异提供了一个新的视角,并有助于对牛肉品质的分子理解。未来的研究工作可以更深入地研究已确定的基因和途径,以提高肉牛的质量和产量。

1题目

文章题目:Identification of key genes and metabolites involved in meat quality performance in Qinchuan cattle by WGCNA

发文单位:西北农林科技大学动物科技学院、草地农业学院;

国家肉牛改良中心

2杂志

Journal of Integrative Agriculture ;IF=4.6分

3链接

http:// creativecommons.org/lic

doi: 10.1016/j.jia.2024.07.044

4检测指标

Norminkoda提供总脂肪检测

5主要内容

Fig 1:秦川牛各肌肉部位的肉质性能

Fig 2: 关键基因的WGCNA分析

Fig 3:基因模块蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络的构建

Fig 4: 代谢物关键基因的WGCNA分析

Fig 5:KEGG分析

Fig 6:转录组和代谢组的联合分析

本研究旨在评估秦川牛4个肌肉部位的10个肉质性状,特别是0和24 h时的TPC、IMF、NEFA、肉色(L*、a*、b*)、SF、CL和pH值。观察不同肌肉部位的表型性状差异。在本实验中,我们构建了基因和代谢物网络,并利用WGCNA鉴定了与所测性状密切相关的模块。此外,通过PPI分析,我们确定了枢纽基因,包括与IMF相关的三个关键基因(NDUFAB1、NDUFA12和NDUFB7),与NEFA相关的三个候选基因(CSRP3、ACAA3和ACADVL),以及一个影响肉色的重要基因(CREBBP)。性状相关基因和代谢物模块的共富集分析导致识别关键途径。这些发现增强了我们对牛不同肌肉部位肉质变化的潜在机制的理解,为未来动物育种和肉质改善的研究提供了有价值的见解。

声明:本文内容及图片部分来源于已见刊的文献,内容观点仅代表个人解读,具体参考原文.



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