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Frontiers in Genetics || 转录组和代谢分析铁线蕨抗旱胁迫反应
1.题目:Metabolomic and Transcriptomic Responses of Adiantum (Adiantum nelumboides) Leaves Under Drought, Half-Waterlogging, and Rewater Conditions.2.杂志:Frontiers in Genetics3.IF:4.77分4.链接:Liang Q, Dun B, Li L, Ma X, Zhang H, Su Y and Wu D (2023), Metabolomic and transcriptomic responses of Adiantum (Adiantum nelumboides) leaves underdrought, half-waterlogging, and rewater conditions. Front. Genet. 14:1113470.doi: 10.3389/fgene.2023.11134705.主要内容:
荷叶铁线蕨(Adiantum reniforme L. var.sineseY. X. Lin)是铁线蕨科(Adiantaceae)铁线蕨属(Adiantum)单叶型常绿植物,国家I级保护濒危物种,仅分布于我国长江流域重庆市万县地区的一段狭长区域内,属三峡库区特有物种并属于铁线蕨科植物中在亚洲唯一分布的植物。由于其居住在悬崖上的习惯,它会经历干旱胁迫条件,这进一步危及它的生存。然而,目前还没有关于其对干旱胁迫的分子研究。研究者通过控制单一环境因子变量水分,观察不同环境下荷叶铁线蕨的生长状况,检测不同环境(干旱,复水)下荷叶铁线蕨生理生化指标和次生代谢成分,探讨影响其生长发育的主要因子;分析荷叶铁线蕨响应不同环境的生理生化指标,基因表达及次生代谢成分变化规律。
实验材料:
CK:对照
半淹水5:半淹水培养第5天;
半淹水10:半淹水培养第10天;
干旱5:干旱培养第5天
干旱10:干旱培养第10天
复水处理5:复水处理第5天
图1.对照和处理组可观察表型的概述和代谢组学概况(Liang,2023)
图2.干旱胁迫和浇水条件下铁线蕨叶片的代谢组学变化(Liang,2023)。
图3.不同处理条件下铁线蕨叶片中差异基因表达(Liang,2023)
图4.关键代谢物分析Liang,2023)
Norminkoda提供转录组数据分析
图5.主要代谢物质和基因分析检测(Liang,2023)
(ROS相关基因分析和苯丙烷相关通路基因分析)
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