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[转载]Genes||转录+代谢+qPCR分析黄精纤维根和直根中黄酮类化合物分布
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黄精以其独特的黄色根茎而闻名，是远东亚地区一种常见的治疗和烹饪植物。药用植物的色调与类黄酮的生物合成和含量水平密切相关。本研究对黄精的纤维根和主根进行了研究，利用转录组学和代谢组学研究了次生代谢物的表达和类黄酮的生物合成机制。代谢分析表明，纤维根和主根中差异积累的代谢物（DAMs）主要是黄酮、类固醇、生物碱和酚酸。共鉴定出200种黄酮类化合物，其中170种在纤维根与主根之间存在差异。转录组分析结果显示，编码32种酶的289个单基因被注释为4种类黄酮生物合成途径，包括类苯丙酮生物合成途径、类黄酮生物合成途径、类异黄酮生物合成途径、黄酮和黄酮醇生物合成途径。
1题目4检测指标5主要内容
6总结代谢组学分析显示，在主根和纤维根中有1206种代谢差异化合物，其中纤维根中142种代谢物，含量较高。在两种根型中共鉴定出200种黄酮，其中黄酮、黄酮醇、二氢黄酮、查尔酮和异黄酮中有170种，其中17种在纤维根中明显丰富。转录组学分析显示，在纤维根和主主根中鉴定出76个与类黄酮合成相关的基因。转录因子如MYB、bHLH和bZIP被发现调控类黄酮的合成。通过结合转录组学和代谢组学，纤维根中类黄酮合成的关键基因和途径。被认为与黄酮、异黄酮、黄酮、黄酮和黄酮醇相关的差异表达基因（DEGs）与差异积累代谢物（DAMs）显著相关。
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Combined Metabolomics and Transcriptomics Analysis of the Distribution of Flavonoids in the Fibrous Root and Taproot of Polygonatum kingianum Coll.et Hemsl.2杂志Genes；IF=2.8分
3链接
转录组+ 代谢组+qPCR
Fig 1：多元统计分析.
Fig 2：代谢物KEGG分析.
Fig 3：转录组GO和KEGG分析.
Fig 4：转录因子分析.
Fig 5：相关性网络分析.
Fig 6：qPCR分析.
声明：本文内容及图片部分来源于已见刊的文献，内容观点仅代表个人解读，具体参考原文.
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