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李漠野
high-throughput sequencing technology
高通量测序技术,是指能够一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定、每一次序列测定的读长一般较短的测序技术。
expressed sequence tags (ESTs)
表达序列标签,是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,应用于新基因发现、基因作图和基因组序列中编码区的确定。
Gordian knot
戈尔迪之结,指难以解决的问题;“cut the Gordianknot”指干脆利落地解决复杂的问题。公元前334年,马其顿的亚历山大大帝在远征波斯途中,来到小亚细亚北部的城市戈尔迪乌姆。戈尔迪乌姆有一座宙斯神庙,庙内有一辆牛车,车轭和车辕之间用山茱萸绳结成一个绳结。几百年来,多少人不断尝试都不能将其解开。最后亚历山大拔剑一挥便将绳索砍断,“戈尔迪之结”迎“刃”而解。
biased sample
有偏样本,总体中的各个体被抽到概率不等而导致的样本,用于简单随机样本的经典统计理论不适用于有偏样本。
linear functional
线性泛函。
discontinuous functional
不连续的泛函。
modulus of continuity
此处指泛函的连续模。
Hellinger distance
用以度量分布的距离,由Hellinger积分定义。
lower semi-continuous
下半连续,比连续更弱。同时满足上半连续与下半连续的函数方为连续函数。
Epigraph
上图象,函数图象之上的点集。
Hankel matrices
Hankel矩阵中的所有元素都与其左下角相邻位置的元素相等。
Stieltjes moment problem
Stieltjes矩量问题,寻求某数列可表示为正半实轴上对于某测度的矩的充要条件,及该测度的唯一性。
EPD-curve
EPD(extended partialdensity)曲线,即扩展部分密度曲线,概念上与力矩曲线(moment curve)类似。
moment curve
力矩曲线,d维欧氏空间中的代数曲线(algebraic curve),其笛卡尔坐标为对应自然数阶的矩次,如它在欧氏平面中是双曲线,在三维空间中是三次挠曲线(twisted cubic curve)。
convex hull
凸包,包含某集合的最小凸集。
linear programming
线性规划,目标函数与约束都是线性的最优化问题。
capture-recapture
捕获-再捕获,物种总数估计方法:先捕获一批生物并做标记,将它们放回栖息地后一段时间再捕获一批生物,用两次分别批捕获的生物的数目,及第二次捕获的带标记的生物数目估计物种总数。
removal sampling
去除取样,物种总数估计方法:连续捕捉而不放回,通过减少种群的数量来估计种群的大小。
catch-effort
捕获-捕获投入,物种总数估计方法:以相同捕获投入(一定数目的电气捕鱼船)进行多次不放回的捕获实验,通过对不断增加的捕获难度建模来估计物种总数。
non-identifiability
不可识别,两个或两个以上的参数/模型可产生相同的样本,即不能从样本估计出唯一的参数。
monotone Boolean function
单调布尔函数。
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