博文
在NIH听Shinya Yamanaka同学讲故事
精选
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Shinya Yamanaka何许人也？俞君英知道吧？就是通过四个转录因子让体细胞变成全能干细胞的大牛。他的工作是诺贝尔奖级的。
Shinya Yamanaka今天的讲座是我这几年来在NIH听到的最精彩的讲座。他做讲座是我喜欢的讲故事的方式，交代了他博后的工作，回日本之后如何引申出干细胞的工作，如何碰巧建立assay，并通过严格的实验和推理筛选到这四个明星转录因子，之后又介绍了他实验室关于干细胞癌化的最新进展。数据简明易懂，不太重要让人头晕的图全不show。中间穿插各种趣事，打趣实验室常见的郁闷，并适时地拿自己的秃头开玩笑。既有宏观的视野和感悟，也有严格的研究线索。观众就在一阵阵笑声中听了一个很有信息量的讲座。
具体说一下他是怎么发现这四个转录因子的：
他回日本之初曾有一段没有帮手自己养400只老鼠的痛苦经历，并得了一种病叫PAD，Post America Depression （从美国回去后的沮丧症）。独立建实验室之后还是没有研究生愿意到他的实验组。为了吸引学生，Shinya Yamanaka提出了一个非常ambitious的目标：把分化后的细胞逆转成多能干细胞。他的假设是存在maintain干细胞多能性的转录因子，如果把这些转录因子过表达，可能会实现细胞分化的逆转。
他根据已有的线索找到了24个在干细胞中高表达，而在分化细胞低表达的转录因子。他把抗G418的基因knock in到其中一个转录因子，建立了一个简便的区分干细胞和分化细胞的办法。也就是这个knock in老鼠的干细胞因为这个因子高表达，所以是抗G418的，而分化的细胞却会被G418杀死。
他的一个学生将这24个因子一一转到分化的MEF细胞中（G418敏感），试图筛到抗G418的克隆，不过实验失败了。这时他的学生提出了一个非常大胆的提议，就是同时把24个因子转到MEF中。结果就真筛出了几十个抗G418的克隆。那么究竟这24个因子哪些因子是最重要的呢？他们从这24个因子中每次去掉一个因子再转化，于是就鉴定到了这四个最重要的因子，去掉其中一个因子都不能产生克隆（其中cmyc不是必需的，但是去掉后克隆数减少很多）。
于是一个划时代的工作诞生了！
我这个复述非常乏味，他在讲这个发现故事的时候那可是有声有色。本次讲座是NIH的头亲自host的，有录像。有兴趣的朋友可以直接到NIH videocast网站去看，免费。
他的讲座录像在这里：http://videocast.nih.gov/PastEvents.asp （找January 14, 2010的录像）
他的被引用一千多次的牛文在这里：http://www.cell.com/retrieve/pii/S0092867406009767
他的头像在这里：
https://blog.sciencenet.cn/blog-320403-287478.html
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下一篇：搭起基础研究和应用研究的桥梁-NIH Chemical Genomics Center简介
Shinya Yamanaka今天的讲座是我这几年来在NIH听到的最精彩的讲座。他做讲座是我喜欢的讲故事的方式，交代了他博后的工作，回日本之后如何引申出干细胞的工作，如何碰巧建立assay，并通过严格的实验和推理筛选到这四个明星转录因子，之后又介绍了他实验室关于干细胞癌化的最新进展。数据简明易懂，不太重要让人头晕的图全不show。中间穿插各种趣事，打趣实验室常见的郁闷，并适时地拿自己的秃头开玩笑。既有宏观的视野和感悟，也有严格的研究线索。观众就在一阵阵笑声中听了一个很有信息量的讲座。
具体说一下他是怎么发现这四个转录因子的：
他回日本之初曾有一段没有帮手自己养400只老鼠的痛苦经历，并得了一种病叫PAD，Post America Depression （从美国回去后的沮丧症）。独立建实验室之后还是没有研究生愿意到他的实验组。为了吸引学生，Shinya Yamanaka提出了一个非常ambitious的目标：把分化后的细胞逆转成多能干细胞。他的假设是存在maintain干细胞多能性的转录因子，如果把这些转录因子过表达，可能会实现细胞分化的逆转。
他根据已有的线索找到了24个在干细胞中高表达，而在分化细胞低表达的转录因子。他把抗G418的基因knock in到其中一个转录因子，建立了一个简便的区分干细胞和分化细胞的办法。也就是这个knock in老鼠的干细胞因为这个因子高表达，所以是抗G418的，而分化的细胞却会被G418杀死。
他的一个学生将这24个因子一一转到分化的MEF细胞中（G418敏感），试图筛到抗G418的克隆，不过实验失败了。这时他的学生提出了一个非常大胆的提议，就是同时把24个因子转到MEF中。结果就真筛出了几十个抗G418的克隆。那么究竟这24个因子哪些因子是最重要的呢？他们从这24个因子中每次去掉一个因子再转化，于是就鉴定到了这四个最重要的因子，去掉其中一个因子都不能产生克隆（其中cmyc不是必需的，但是去掉后克隆数减少很多）。
于是一个划时代的工作诞生了！
我这个复述非常乏味，他在讲这个发现故事的时候那可是有声有色。本次讲座是NIH的头亲自host的，有录像。有兴趣的朋友可以直接到NIH videocast网站去看，免费。
他的讲座录像在这里：http://videocast.nih.gov/PastEvents.asp （找January 14, 2010的录像）
他的被引用一千多次的牛文在这里：http://www.cell.com/retrieve/pii/S0092867406009767
他的头像在这里：
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