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新冠疫情期间对预印本服务器的使用

已有 3079 次阅读 2020-8-28 16:14 |系统分类:观点评述| 新型冠状病毒, 预印本服务器, 预印本

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预印本服务器是一些线上档案,用来存储未经同行评议的专业论文。我们之前讨论过,研究人员有时会在将论文提交给传统的同行评议期刊前先发布到预印本服务器上,这样做主要是出于两个原因,一方面是为了更快地传播数据,另一方面也让他们的作品以一种更容易被广泛获取的形式存在。


在新冠疫情期间,出版速度和信息的可获取性越来越重要。在这样特殊的时期,预印本服务器上充斥着大量有关新冠疫情的论文,与此同时,预印本也获得了前所未有的关注,包括研究人员、媒体、乃至大众也开始注意到这一资源。


在这篇文章里,我们来讲一讲预印本服务器的使用及其政策在新冠疫情期间发生了哪些改变,以及这些改变在眼下和未来会产生哪些影响。


疫情对预印本发表带来的早期影响


在预印本服务器上发布论文最大的优势就是发表速度快,从提交到发表一般只需要1-2天,而在传统期刊发表论文则要经过同行评议,通常要等几个月甚至一年多的时间才能发表。


能够快速发表论文在疫情期间显得尤为重要,因为研究人员想要在快速全球化的背景之下将他们对疫情的研究结果快速传达出去。自从疫情开始,提交给预印本服务器并在服务器上发表的论文数量急剧增加,这也让研究人员对预印本发表产生了前所未有的热情。事实上,2020年5月23日,Fraser等人在bioRxiv上发表的一篇文章中表示:“在第一例确诊病例后的4个月内,有超过1.6万篇与新冠疫情相关的科学论文(得到了发表),其中至少6000篇论文是在预印本服务器上发表的。”


Fraser等人报告说,除了论文发表数量急剧增加之外,有关新冠疫情的预印本浏览和分享频率也明显高于非新冠疫情内容,摘要的浏览频率提高了15倍,PDF文本的下载频率提高了30倍,这些文章在社交媒体上的分享频率也显著提高。


在预印本服务器上发表新冠疫情论文所带来的问题


诚然,在预印本服务器上发布与新冠疫情相关的论文有诸多好处,但一些弊端也逐渐显露出来。与其他发布在预印本服务器上的论文一样,有关新冠疫情的研究在发布前也没有经过同行评议,而随着这些预印本受到更严格的审查和更大力度的宣传,其科学可靠性也出现了一些问题。迄今为止最恶劣的一起案例,是一篇发表在bioRxiv上的论文,其声称新型冠状病毒与艾滋病毒之间存在实质性的同源性。该报告很快就受到了多位研究者的反驳,论文也已经被撤下(这对于预印本来说是很少见的)。但遗憾的是,由于这篇论文已被媒体广泛引用和报道,助长了有关病毒起源的阴谋论,因此已经不可避免地造成了一些伤害。


另一个引起担忧的问题是,一些发表在预印本服务器上的论文或含蓄或明确地宣扬新冠疫情的各种治疗方案,而如果是一份标准的同行评议论文,在其发表前就可以判断论文中展示的研究成果在开发疾病治疗方案方面的潜在适用性。事实证明,正是因为没有同行评议,让这些新冠疫情相关的预印本出现了问题。如前所述,由于公众对预印本文章越来越感兴趣,没有科学背景的读者可能会对这些推测作出错误的解读,甚至可能尝试这些未经测试、未经证实的“治疗方法”,这样就可能会危害自己和他人的健康。


为应对新冠疫情,预印本服务器近期作出的一系列改变


为了应对在疫情初期出现的诸多挑战,预印本服务器采取了一系列措施,以澄清所存档论文的性质,并减少潜在的负面影响。比如说,bioRxiv在其发布的每篇新冠疫情预印本的页眉中都添加了以下免责声明:“本文为预印本,未经同行评议认证。”而medRxiv则更进一步,在每一篇新冠疫情预印本的开头都作出了明确声明:“本文为预印本,未经同行评议认证。文章所述的最新医学研究尚未经过评估,因此不应用于指导临床实践。”


除了添加免责声明,一些预印本服务器也在改变新论文发布之前的筛选方式。今年6月发表在《化学与工程新闻》上的一篇文章称,现在ChemRXiv在发布新提交的文章之前会更彻底地进行检查,避免给大家留下比如仅根据计算数据就推荐药物治疗的负面印象。


各机构颁布的有关发表新冠疫情预印本的政策


有意思的是,预印本服务器不仅因为研究人员的浓厚兴趣而在科学出版中扮演着更加重要的角色,还得到了传统期刊、资助机构以及其他机构的积极推广。


今年一月份,Wellcome牵头达成了一项协议,承诺加快传播与新冠疫情相关的所有研究。该协议最显著的特点是鼓励使用预印本服务器,此外,还采取了一系列其他措施,如对所有关于新冠疫情的论文实行开放获取,甚至是发表在传统期刊上的论文,以及向世界卫生组织通报所有相关数据的政策等等。许多机构、团体和期刊目前都签署了这一协议,承诺秉持同样的原则。例如,《新英格兰医学杂志》在一月底发表了一篇社论,概述了该杂志在新冠疫情相关研究方面的新举措,其中第一点就强调了与公共卫生当局共享数据并在预印本服务器上共享数据。


除了鼓励使用预印本服务器,《eLife》等期刊还制定了一项政策,规定将所有提交的论文发布在预印本服务器上,一方面让人们可以自由访问这些内容,另一方面,由于疫情期间同行评议的进程更加缓慢,因此这一政策能够确保所有的研究都能在这一非常时期得到发表。Springer Nature也制定了类似的政策,为了助推政策的实施,他们近期还推出了自己的预印本服务--In Review。作者在将论文提交给《自然通讯》杂志和《自然生物医学工程》杂志时可以选择加入该预印本服务器。


此外,美国国立卫生研究院(NIH)已启动一个试点项目,为PubMed Central中由NIH资助的研究建立预印本索引。该项目目标明确,即提高新冠疫情相关文章的可获取性。在采访ASAPbio时,PubMed Central的项目经理Kathyrn Funk强调,拥有“明确的指标,对某一预印本及其背景进行记录非常重要”。她还指出,该索引中列出的所有预印本都将用清晰的标签做出标记。


与新冠疫情预印本发表相关的倡议


总部位于约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院的《新型冠状病毒研究汇编》是由一批志愿者创建的一份周报,该报对新冠疫情的最新研究(包括发表在预印本服务器上以及传统期刊上的论文)进行评估,简要总结每篇论文的主要观点,并附上对研究质量的评估。发表在《霍普金斯布隆伯格公共卫生杂志》上的一篇文章表示,《汇编》的志愿者“还会审阅那些吸引了媒体关注,但可能有重大局限性的论文”,帮助没有科学背景的读者对这些论文的可靠性进行更公允、更严格的评定。


另一个有意思的举措是《快速评议:COVID-19》的创刊。这是一本由麻省理工学院出版社出版的“Overlay”期刊,旨在加强同行评议,促进与新冠疫情相关预印本的发表。Overlay期刊的理念是选择已经发布的预印本进行评议,这样就可以找到重要的内容进行评议和传播。STAT发表了一篇对《快速评议:COVID-19》主编Stefano Bertozzi进行的采访,采访中指出,该期刊旨在快速评议那些对医疗系统和普罗大众最有用的研究,“以及需要被证实或反驳的研究,尤其是在媒体或社交媒体上获得大量关注的研究。”通过这种方式,科学界可以帮助新闻界和公众对研究的质量和可靠性进行正式评估,从而避免研究被曲解。


总结


总而言之,新冠疫情对整个研究界使用预印本服务器的方式产生了巨大影响。最出乎意料的是,公众和媒体都开始使用预印本中的内容,这既带来了正面效应,但同时也伴随着负面影响:公众能够近距离“目睹”科学研究的过程,见证科研界是如何产生科学发现,对其进行评议,以及证实或反驳这些发现;但问题是,公众并不总是能够很好地理解同行评议和非同行评议内容之间的区别。在新政策的辅助下,加上媒体对预印本内容更负责任的使用,很可能会有效地解决这些问题,从而帮助公众了解新冠疫情,并确保预印本服务器继续在全球抗疫中发挥积极与核心作用。除此之外,针对评估预印本论文而提出的新倡议也将提出更加严格的预印本评估标准。新型冠状病毒对我们生活的方方面面都造成了影响,而未来,它很可能会对科学出版、特别是预印本服务器产生持久影响。





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