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科研必备的化学数据库都在这里了,拿走不谢

已有 30033 次阅读 2017-11-20 22:23 |系统分类:科研笔记| 化学数据库

大多数情况下,我们一般习惯使用互联网搜索引擎进行科学信息搜索。比如说利用Google Scholar查找科学文献。还有维基百科,可能是先进覆盖面最广的一种百科资料,这里面可以快速提供你想要的信息,并帮助你进一步链接新的主题。

但是这些常见常用的搜索引擎检测到的信息只不过是沧海一粟。对于科研人员而言,相对较为权威和专业的信息和资料的获取,则需要相应的搜索方法和技巧。

1、The Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC)

网址:https://www.ccdc.cam.ac.uk/

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汇集目标为有机物和金属有机物的晶体结构资源库,对于有机化学,尤其是金属有机的从业者,是必备的数据库。推荐对象:有机化学、金属有机化学从业者;来源:英国剑桥晶体学数据中心(The Cambridge Crystallographic Data Centre)

2、ChemSpider(Search and share chemistry)

网址:http://www.chemspider.com/

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汇集目标以化学结构式为基础的化学信息资源,涵盖物质基础理化性能、物质合成的路线以及参考文献等多种信息,专业数据库,超过四千三百万种的结构、属性以及相关信息数据推荐对象:化学从业者;来源:英国皇家化学协会(Royal Society of Chemistry -RSC)现有手机APP可以使用!

3、ChemSub Online

网址:http://chemsub.online.fr/

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汇集目标以分子信息为主的化学物检索,涵盖目标化合物的基本信息,为个人数据库。推荐对象:化学从业者;来源:Robert Charles Knight和Aniruddha Warakoutikha

4、ChemSynthesis

网址:http://www.chemsynthesis.com/

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汇集目标已知化学物的物化性能,如:熔点、沸点,可作为合成的已知物的参照物,数据涵盖化学超过40,000,参照物超过45,000。推荐对象:化学从业者;来源:ChemSynthesis 小组

5、NIST Chemistry WebBook

网址:https://www.nist.gov/

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汇集目标已知化学物的物化性能,如:熔点、沸点,可作为合成的已知物的参照物,数据涵盖化学超过40,000。推荐对象:化学从业者。

来源:美国国家标准与技术研究所(NIST)

6、Org Syn(Organic Synthesis)

网址:http://www.orgsyn.org/

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汇集目标有机化合物合成反应以及合成路线,操作详细,可以作为文献参考使用。推荐对象:化学从业者。

来源:Organic Syntheses, Inc.

7、IUPAC Standards Online

网址:https://iupac.org/

国际理论和应用化学联合会(IUPAC)标准数据库,提取自Pure and Applied Chemistry杂志。

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来源:德国Walter de Gruyter股份有限公司

8、PubMed

网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

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来自MEDLINE、生命科学期刊和在线图书的两千四百多万个生物医学文献引文,引文包含了PubMed Central和发行网站的全文内容链接。

来源:美国国家生物技术信息中心(NBI)丨美国国家医学图书馆丨美国国立卫生研究院

9、Science of Synthesis

网址:https://www.thieme.de/en/thieme-chemistry/science-of-synthesis-54780.htm

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包括有机和有机金属化学从十九世纪至今所研发的合成方法的评论。

来源:Thieme

10、SciFinder

网址:http://www.cas.org/

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化学与相关科学中的参考文献、物质和反应的综合权威资源。

来源:化学文摘社(CAS)

限于篇幅,以下数据库不再做详细介绍。简单介绍如下:

Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI)

专注于小分子化合物。

来源:英国欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatic Institute)隶属Open Biomedical Ontologies


Chemicalize.org

提供基于网页端的化学结构鉴定功能及其他文本,部分功能免费。

来源:匈牙利ChemAxon


ChemInform RxnFinder

属于ChemInform Reaction Library (CIRX)的一种搜索引擎服务,包括了从1990年到现在100多种期刊中的两百多万种反应数据。是合成有机化学家的工具。

来源:Wiley


TOXNET

包含的数据类型有化合物与药物、疾病与环境、环境健康、职业安全卫生、毒害、风险评估与法规以及毒理学。

来源:美国毒理学与环境健康信息计划(Toxicology and Environmental Health Information Program)


ChemPlanner

通过预测合成策略和一系列广泛的相关合成方法以及可用构建帮助化学家为目标分子设计不同的合成路线。

来源:Wiley


Computer Aided Material Preselection by Uniform Standards (CAMPUS)

来自参与材料生产商的树脂数据库,这里的数据库仅包括了严格执行统一标准的可比较的材料信息。

来源:德国Chemie Wirtschaftsf?rderungs股份有限公司


Crystal Works

Chemical Database Service提供了大量的晶体结构数据。

来源:英国科技设施委员会(Science and Technology Facilities Council)


Derwent World Patent Index (DWPISM)

主要为专利信息数据。

来源:汤森·路透(Thomson Reuters)


DETHERM

纯物质和混合物的热物理数据。

来源:德国DECHEMA e.V


Dmoz – NMR spectra Database

核磁共振谱数据。

来源:全球志愿编辑社区(global community of volunteer editors)


Drug Bank  http://www.drugbank.ca

将详细药物数据与综合全面药物标靶信息结合的生物信息学与化学信息学数据库。

来源:加拿大国立卫生研究所(Canadian Institutes of Health Research)丨阿尔伯塔创新-健康解决方案(Alberta Innovates – Health Solutions)丨代谢组学创新中心(TMIC)


eMolecules

化学物质信息提供者。

来源:eMolecules, Inc.


Electronic Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis (eROS)

为所有从事有机合成工作的化学家提供的试剂和催化剂信息。

来源:Wiley


Eurochem

化学与相关行业的综合指导目录及搜索引擎。

来源:瑞士欧罗化工集团股份公司(EuroChem Group AG)


hmdb – The Human Metabolome Database

人类内发现的小分子代谢物数据的详细信息。

来源:加拿大代谢组学创新中心(The Metabolic Innovation Centre)


Inorganic Crystal Structure Database (ICSD)

完整地无机晶体结构鉴定,包含了177,000同行评审过的数据条目。

来源:德国FIZ卡尔斯鲁厄股份有限公司-莱布尼兹的信息基础设施研究院(FIZKarlsruhe – Leibniz-Institut für Information sinfrastruktur)


International Patent Documentation Center Database (INPADOC)

国际专利汇总,包含同族专利和法律状态信息,每周更新。

来源:欧洲专利局(European Patent Office—EPO)


KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes

分子水平层面的生物系统高级功能与效用数据库资源,尤其涵盖了基因组测序和其他高通量实验技术产生的大规模分子数据集。

来源:Kanehisa实验室


Merck Index

化学品、药物和生物制品的大百科全书,10,000个单一物质或者相关化合物基团专着,包括有机命名反应专论附录。

来源:英国皇家化学协会(Royal Society of Chemistry—RSC)


MMsINC Search

商用虚拟筛选和化学信息学使用列表。

来源:意大利帕多瓦大学


NMRShiftDB

有机结构的核磁共振(NMR)光谱数据,可以进行频谱预测((13C、 1H及其他原子核),光谱、结构及其他属性的搜索。

资料来源:NMRShiftDB 项目


eChemPortal

生态毒性、环境归趋和命运及毒性的物理化学属性。

来源:经济合作与发展组织(OECD)


OpenFoodTox

欧洲食品安全局(EFSA)风险评估使用的毒理学信息摘要,包括食物和喂送链中的有毒物质,每年更新一次。

来源:欧洲食品安全局(EFSA)


PubChem  http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov

小分子的生物活性信息。

来源:美国国家生物技术信息中心(NBI)


Reaxys

Beilstein和Gmelin数据库的引用数据,包括化学专利。

来源:Elsevier


Spectra Lab

使用经验谱数据(二百二十多万条MS、NMR和IR 光谱)的光谱数据系统,先进的软件功能可以帮助化学家、毒理学家和生命科学家鉴定化学物质。

来源:Wiley


Spectral Database for Organic Compounds (SDBS)

有机化合物的综合光谱数据库系统,包括34.600个化合物的六种不同类型的光谱(EI-MS、1H-NMR、13C-NMR、FT-IR、Raman、ESR)。

来源:日本国家先进工业科学技术研究所(AIST)


Springer Materials

250,000种材料和化学系统的3000个物理和化学属性的数值和图形数据。

来源:Springer


ZINC  http://zinc.docking.org

专门为虚拟筛选搜集的商用化合物,包含三千五百多万中化合物的3D格式。

来源:美国加利福尼亚大学旧金山分校Irwin和shoichet实验室

原文链接:http://www.ekexiu.com/shtml/a/20171113/102766.html




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1 刘立明

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