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MBE:大范围系统发育基因组学分析揭示陆地植物的起源时间

已有 2425 次阅读 2021-5-4 12:25 |个人分类:每日摘要|系统分类:论文交流

Large-scale phylogenomic analyses reveal the monophyly of bryophytes and Neoproterozoic origin of land plants

第一作者Danyan Su

第一单位南京师范大学

通讯作者Bojian Zhong


 Abstract 


背景回顾The relationships among the four major embryophyte lineages (mossesliverwortshornwortsvascular plants) and the timing of the origin of land plants are enigmatic problems in plant evolution. 


结果1-苔藓类植物的单系起源::Here, we resolve the monophyly of bryophytes by improving taxon sampling of hornworts and eliminating the effect of synonymous substitutions. 


结果2-陆地植物起源时间估计:We then estimate the divergence time of crown embryophytes based on three fossil calibration strategies, and reveal that maximum calibration constraints have a major effect on estimating the time of origin of land plants. Moreover, comparison of priors and posteriors provides a guide for evaluating the optimal calibration strategy. By considering the reliability of fossil calibrations and the influences of molecular data, we estimate that land plants originated in the Precambrian (980 − 682 Ma), much older than widely recognized. 


结论:Our study highlights the important contribution of molecular data when faced with contentious fossil evidence, and that fossil calibrations used in estimating the timescale of plant evolution require critical scrutiny.


 摘 要 


藓类植物(mosses)、苔类植物(liverworts)、角苔植物(hornworts)和维管植物(vascular plants四个胚胎植物主要谱系之间的系统发育关系及陆地植物起源的时间是植物演化中的一个谜。本文中,作者通过增加角苔的物种取样和屏蔽同义替换的影响,发现苔藓类植物(bryophytes,包括藓类、苔类和角苔植物)属于单系起源。作者进一步基于三种化石标定策略,估计了胚胎植物谱系的冠群时间(crown age,即某一类群内部开始发生分化的时间;对应的概念是stem age,即某一类群所有物种的共同祖先起源时间),发现最大标定约束对陆地植物起源时间的估计起主要影响。此外,先验和后验的比较为评估最佳化石标定策略提供了指导。结合化石标定的可靠性和分子数据的影响,作者估计陆生植物起源于前寒武纪(约980 − 682 百万年前),比之前公认的时间还要古老得多。本文的研究强调了当面对有争议的化石证据时,分子数据具有非常重要的作用,并且用于估计植物演化时间尺度的化石标定时间需要严格的审查。


 通讯作者 

** 钟伯坚 **


个人简介:

2003-2007年,中国地质大学,学士;

2007-2010年,复旦大学,硕士;

2010-2014年,新西兰梅西大学,博士。


研究方向植物系统发育基因组学;植物多样性与适应性进化;植物光信号通路的分子演化。


doi: https://doi.org/10.1093/molbev/msab106


Journal: Molecular Biology and Evolution

Published date: April 19, 2021



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