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文献来源 Qin P, Qin T, Liang L, et al. The role of mitochondrial DNA copy number in cardiometabolic disease: a bidirectional two-sample mendelian randomization study. Cardiovasc Diabetol. 2024;23(1):45. Published 2024 Jan 28. doi:10.1186/s12933-023-02074-1elzer
研究背景
线粒体是细胞的“能量工厂”和自由基代谢中心,线粒体功能与线粒体DNA(mtDNA)的数量和质量紧密相关。线粒体DNA的数量,即线粒体DNA拷贝数。mtDNA拷贝数变异引起线粒体功能紊乱,与衰老及多种疾病如糖尿病、心血管疾病、神经系统疾病和肿瘤等密切相关。细胞基因组DNA抽提试剂盒获得的DNA中包含了基因组DNA和线粒体DNA。研究人员一般利用每个细胞中线粒体DNA拷贝数(例如:300拷贝/细胞)作为一个相关研究参数。
外周血游离线粒体DNA(circulating cell free mitochondrial,ccfmtDNA):是血液中游离细胞外的线粒体DNA,其来源可能有内源性和外源性两条途径,一方面源自于体内肿瘤组织的凋亡、坏死或肿瘤细胞的内分泌作用;另一方面可能来源于体外凝血过程中白细胞的释放。ccfmtDNA可作为一种非侵袭性的潜在适用性较大的肿瘤标志物。科研人员一般利用每毫升血液或每毫升血清中游离线粒体DNA拷贝数(例如:300拷贝/1mL全血、300拷贝/1mL血清)作为一个相关研究参数。
研究概述
【研究方法】
入组志愿者:全基因组关联研究(GWAS)分析了英国生物银行中395,718名主要为欧洲血统的参与者的线粒体DNA拷贝数。进一步验证研究参考了2022年Longchamps等人发布的研究成果,该成果基于基因组流行病学中心心脏与衰老研究联盟(CHARGE)和英国生物银行(UKB)中465,809名白人的线粒体DNA拷贝数相关的GWAS汇总数据。
双向孟德尔随机化框架研究设计概述:共进行了16次孟德尔随机化(MR)分析,以研究线粒体DNA拷贝数与心血管代谢疾病(包括肥胖、高血压、血脂异常、2型糖尿病、冠状动脉疾病、中风、缺血性中风和心力衰竭)之间的双向关联。
关于2型糖尿病(T2DM):通过选取与线粒体DNA拷贝数密切相关的特定单核苷酸多态性(SNPs)作为工具变量,本研究旨在探索线粒体DNA拷贝数与2型糖尿病风险之间的潜在因果联系,并进行了反向探究,使用与2型糖尿病风险相关的SNPs预测线粒体DNA拷贝数的变动。这一过程假设如果线粒体DNA拷贝数与2型糖尿病有因果关系,则相关SNPs也应与糖尿病风险相关,反之亦然。
为确保研究结果的可靠性,考虑到可能存在的混淆因素,本研究采用了多种统计方法,如逆方差加权(IVW)、加权中位数、MR-Egger等,以增强结果的稳健性并尝试纠正偏倚。这些方法助力于更精确地评估线粒体DNA拷贝数与2型糖尿病风险之间的因果关系。
图:双向孟德尔随机化框架研究设计概述,用于研究线粒体DNA拷贝数对心血管代谢疾病的因果效应。
【研究结果】
遗传预测的线粒体DNA拷贝数与心血管代谢疾病的关联
6694个单核苷酸多态性(SNP)与线粒体DNA拷贝数呈现相关性。经过筛选,排除了因高度连锁不平衡(LD)而可能产生的干扰,最终确定了62个SNP与线粒体DNA拷贝数及心血管代谢疾病具有相关性。采用正向孟德尔随机化(MR)分析的结果表明,线粒体DNA拷贝数与多种心血管代谢疾病的风险因素,包括肥胖、高血压、血脂异常、2型糖尿病(T2DM)、冠状动脉疾病(CAD)、中风、缺血性中风和心力衰竭之间并不存在显著的关联性。
遗传预测的心血管代谢疾病与线粒体DNA拷贝数的关联
分析发现,血脂异常与线粒体DNA拷贝数的降低显著相关(β=-0.060,95% CI -0.044至-0.076;P=2.416e-14)。此外,对心血管代谢疾病整体的分析也揭示了其与线粒体DNA拷贝数降低之间的潜在因果联系(β=-0.021,95% CI -0.003至-0.039;P=0.025)。通过敏感性和重复性分析,这些发现被证实具有稳定性,强化了心血管代谢疾病与线粒体DNA拷贝数之间可能存在的因果关系。
线粒体拷贝数变化量与年龄关系
本文提示
这项研究通过孟德尔随机化方法探索了线粒体DNA拷贝数与心血管代谢疾病之间的关系,并未发现二者存在直接的因果联系。然而,研究发现血脂异常和冠状动脉疾病(CAD)可能会导致线粒体DNA拷贝数减少,暗示线粒体DNA拷贝数可能作为这些状况的生物标志物具有应用潜力。
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