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漫谈复杂网络1-我为什么关注链路预测 精选

已有 32981 次阅读 2009-12-3 03:10 |个人分类:生活点滴|系统分类:科研笔记

圈子成立了,都说话了写博文支持,但是实在是忙,拖了一天又一天。
 
从最近的东西往回写,总是要容易一些,所以先说说复杂网络上的链路预测(link prediction)吧。这个方向我从09年才开始做,还算比较新。印象中我还从来没有正式讲过这方面的题目,倒是吕琳媛在成都香港都讲过。那就捡重要的说说吧。
 
链路预测这个问题非常简单,就是给定一个网络,让你根据现在已知的链接情况,预测未知的链接。当然,测试算法是否准确,一般来说都是随机取出一些边,假设是不知道的,再看预测的结果是否准确。
 
为什么要研究这个问题了,我觉得有三点。第一是研究链路预测问题可以帮助我们理解网络演化的内在机制。比如针对一个特定的含时演化网络,七七八八的人提出了若干模型(若干机制),都可以生成一些人工网络。里面有一些簇系数接近,有一些平均距离接近,有一些模块结构类似,有一些度分布更像(模块结构和度分度哪个更像,还真不是个简单问题),那么怎么办呢,什么机制更可信呢,直接从网络拓扑特征来看不好比较。链路预测提供了一种比较简单的方法(而且只有一个指标,这个是关键,比如你要找老婆只看胸大胸小,这个就容易了;还要贤惠聪明漂亮体贴——一旦综合考虑,就麻烦了),只需要根据时间先后,把最后M条边移走不要(一般是几百到几千),然后根据各自的机制从M条边以前演化生长,看看谁能把那M条边长出来,至少谁能长得最准确,就是个判断标准了。
 
第二就是这个咚咚可以用来评估各种节点相似性的度量指标。节点相似性是个基本问题,聚类啊,群落啊,都和这个有关系。在很多情况下,可以假设越相似的节点越容易相连(不完全,比如性关系网络,男的和男的连,毕竟是少数),那么利用这个相似性指标进行链路预测,有的效果好有的效果坏,优劣就出来了(当然不是绝对的,但是有参考价值)。举个例子说吧,今年我写了篇狗屎文,讨论了9个比较有名的只考虑公共邻居的相似性指标,比较他们的链路预测精度。然后我提出一个也只考虑公共邻居的指标,把那9个都灭了。这个文章写完也就算了。后来又出了一篇Physica A的论文,在实际系统中发现用我那个指标做加权,效果好;最近又审到一篇论文,重新比较了9+1个指标做群落划分,发现还是我那个好。说明这个链路预测还是能够经得住考验的。
 
第三就是应用起来有前景。比如说蛋白质折叠网络、新陈代谢网络、基因调控网络等等生物网络,一条边是否存在,完全靠实验。由于实验很贵,如果能够在实验前先作预测,而且预测精度还行,好歹能够省两个钱。这个就叫做missing link prediction——预测本来存在但是我们还不知道的。还有比如在线的社区网络,可以通过这个方法进行预测,根据预测结果推荐朋友。这个叫做link prediction for evolving networks——预测将来可能存在的连接。这两种应用研究都大有可为。
 
现在主流的方法是基于相似性的方法,因为很多复杂的方法都可以归根到底落入相似性的圈子里面。当然,机器学习也是主流,关系模型也是主流,但是我都搞不懂,而且这些工作一般需要知道一些其它信息,比如每个点的内容、属性等等,物理上不简洁。至于这个方向会如何发展,我们准备怎么做下去,限于水平(毕竟所涉不深),就不在这里谈了。
 
------5篇推荐文献------
[1] L. Getoor, C. P. Diehl, Link Mining: A Survey, ACM SIGKDD Explorations Newsletter 7 (2005) 3.
[2] D. Liben-Nowell, J. Kleinberg, The Link-Prediction Problem for Social Networks, J. Am. Soc.
Inform. Sci. Technol. 58 (2007) 1019.
[3] A. Clauset, C. Moore, M. E. J. Newman, Hierarchical structure and the prediction of missing links in networks, Nature 453 (2008) 98.
[4] T. Zhou, L. Lü, Y.-C. Zhang, Predicting missing links via local information, Eur. Phys. J. B 71 (2009) 623.
[5] L. Lü, C.-H. Jin, T. Zhou, Similarity index based on local paths for link prediction of complex networks, Phys. Rev. E 80 (2009) 046122.
 
 
------相关链接------
 


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