xbinbzy的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xbinbzy

博文

ggbiplot安装过程中遇到的问题

已有 16098 次阅读 2019-5-14 08:50 |个人分类:R语言画图|系统分类:科研笔记

    最近在R中安装ggbiplot,遇到如下状况,此文特此记录。

安装命令根据https://github.com/vqv/ggbiplot 提示,

library(devtools)
install_github("vqv/ggbiplot")

1)为此首先安装devtools包,

install.packages("devtools")

提示报错信息:

WARNING: Rtools is required to build R packages, but is not currently installed.

https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/ 下载对应版本安装,

2)随后执行

install_github("vqv/ggbiplot")

过程中,出现报错信息如下“lazy loading failed for package ‘ggbiplot’”:

企业微信截图_15577944958763.png

google了一下解决方案,根据https://stackoverflow.com/questions/55319449/package-ggbiplot-is-not-available-for-r-version-3-5-3# 此文提示,直接尝试运行

install.packages("C:/Users/xiaobin/AppData/Local/Temp/RtmpqgjGPv/filec98460e1cfe/ggbiplot_0.55.tar.gz")

提示安装成功,输入library(ggbiplot),显示如下:

企业微信截图_15577944958763.png

3)试运行案例

library(ggbiplot)
data(wine)wine.pca <- prcomp(wine, scale. = TRUE)
ggbiplot(wine.pca, obs.scale = 1, var.scale = 1,  groups = wine.class, ellipse = TRUE, circle = TRUE) +
  scale_color_discrete(name = '') +
  theme(legend.direction = 'horizontal', legend.position = 'top')

图显示如下:

1.jpeg



https://blog.sciencenet.cn/blog-306699-1178887.html

上一篇:分娩方式对早产儿的肠道微生物不存在长期影响
下一篇:文章Clinical metagenomics的解读2
收藏 IP: 210.21.228.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (3 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-11-16 05:16

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部