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metagenome可视化工具Krona

已有 6013 次阅读 2018-6-13 14:26 |个人分类:数据分析|系统分类:科研笔记

 Krona的原文参考详见 :https://github.com/marbl/Krona/wiki

具体在Windows和Linux的安装和基本使用见:

https://github.com/marbl/Krona/wiki/KronaTools

https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/80646056


根据个人使用经验:

1)windows下使用时

     需要用带宏的excel去操作,也就是Krona.xltm文件,具体使用时可将数据按期格式进行修改

     案例当中healthiness那一列删除后重新画图,对图形未有影响


2)Linux安装时

     由于下载的包是KronaTools-2.7.tar不是压缩文件,为此解压命令tar -xvf KronaTools-2.7.tar即可

     perl install.pl安装时如果没有root权限,或者说有特意指定的安装目录,用perl install.pl --prefix *即可

     不同格式数据的使用可参考

      https://github.com/marbl/Krona/wiki/Importing-from-supported-tools



https://blog.sciencenet.cn/blog-306699-1118761.html

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