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clusterProfiler的安装:
连网,参考http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/clusterProfiler.html
个人利用Mac在操作时,将
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")修改成
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")然后成功安装。
对于一些非模式的物种,在准备clusterProfiler需要的文件时,需要用到包,安装参考:https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/AnnotationHub.html
在使用AnnotationHub 过程中,可能会出现cannot open: HTTP status was '500 Internal Server Error'报错信息,这个时候需要更新R和Bioconductor,解决可参考https://support.bioconductor.org/p/76605/
对于clusterProfiler的具体使用,可参考
非常好用的工具
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