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课题组小型cluster的搭建

已有 6257 次阅读 2011-2-25 07:56 |系统分类:科研笔记| 小型cluster搭建, matlab安装


硬件:16台PC机,其中1台做主节点(DELL CPU 2核,内存2G, 硬盘1T,双网卡),15台做为计算节点(ThinkCenter CPU 4核,内存4G,硬盘300G),24口交换机一台(Netgear),cat 5 以上网线若干。
软件平台:rocks cluster 5.2

安装
1.主节点安装rocks cluster 5.2。光驱启动,在命令提示下输入build,后面会出现若干提示框,依次输入信息即可。
2.主节点启动后,进入终端,输入insert-ethers,选compute,启动计算节点,以PXE启动方式即可,同时insert-ethers窗口上会显示计算节点网卡信息。
3.matlab安装,首先找个unix版的matlab。新建用户xxxgroup,并把他的组属性为xxxgroup,把matlab安装与该用户文件夹下/home/xxxgroup/xxxsoft/...,新建其他用户,并把组属性改成xxxgroup。
4.cluster使用,写脚本job.sh:
#!/bin/sh/
#$ -j n
#$ -o job.out
#$ -e job.err
#$ -cwd
/home/xxxgroup/xxxsoft/matlab/R2009a/bin/matlab -nosplash -nodesktop -r xxx.m

qsub job.sh即可投任务。





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