生物技术创新创业分享 http://blog.sciencenet.cn/u/SNPs 美国HudsonAlpha研究院的研究员。做分子鉴别诊断平台技术的开发和免疫组库基础科研。

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为旧金山分子医学“三中全会”准备“爆料”

已有 3959 次阅读 2011-2-14 01:08 |个人分类:生物技术创新创业|系统分类:科研笔记| 工程师, 旧金山

上个星期,工程师们忙碌了几天给去参展的仪器打包:


会议是下个星期(23-25日)在旧金山开的分子医学方面的三合一的会。这个会我一般不去,不过多年前(大概97年)就是在这个会上知道Luminex公司并开始和他们合作的。所以这个会议是有关分子生物学,分子诊断,和分子治疗方面展示技术平台的一个好机会。和以前我们参加的分子病毒年会分子病理年会等不同,参加这个会终端用户不是很多,但是是行业之间交流,合作的好机会。

参展是个很费钱和精力的事,可是又是做市场不可缺少的。

会上我们会发布一个“新闻”:就是我们的iCubate平台除了是一个全自动的分子诊断平台以外,还能做Illumina测序平台的配套仪器,全自动地完成建库(library prep)的工作。在前两天的一篇博客里面我还提到建库是新一代测序的软肋。而iCubate平台巧好能协助解决这个问题。虽然iCubate技术平台不是为高通量测序平台研发的,但是我们可以把建库的所有步骤(三四个酶反应,加中间用磁珠提纯)在卡盒里面完成。这样可以是HiSeq平台更容易掌握,出错率降低,更适合推广。

这也是我去年八月份去Illumina拜访后开始进行的工作,是我们实验室和我们研究院的Shawn Levy 博士合作(他主管研究院的测序服务中心)研发的。

iCubate技术平台不仅仅是一个针对临床的分子诊断平台,也是一个开放的科研工具平台。它不单能做PCR,还可以做miRNA多重检测,免疫组库筛查等许多工作。现在又“意外”地多了一个为高通量测序平台建库的功能。

许多其它公司也在试图开发全自动建库的技术平台,比如安捷伦公司的自动化平台。也有一些做微液体技术的公司试图在自动建库方面有所突破。不过许多努力都是朝着“高通量”方面走的:一个平台同时为96个或更多个标本建库。可是,在一般的实验室,需要测序的标本是一个一个来的,如果能把单个标本的建库问题解决了,建库后可以把Barcode标记好的标本混合起来一起测序来降低测序成本。

这次去旧金山还会和Illumina公司的管理层会谈,商定合作方式。




https://blog.sciencenet.cn/blog-290052-412673.html

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