系统生物学（systems biology）提出和创立于20世纪60-70年代。

贝塔朗菲在1968年《一般系统论》提倡系统、整体和数学方法的开放生物系统研究，Mesarovic D.在1968 年国际系统理论与生物学 (systems theory and biology) 会议上提出“系统生物学（systems biology）”术语*，并与R.Rosen编辑出版了论文集；但是，在分子生物学的突飞猛进中几乎沉寂了。

直到80年代中国的系统科学和综合哲学热潮，曾邦哲读到1970年R.Rosen的系统分层次理论数学方程，以及在中西医学比较中形成拓扑学、图论等思维，1992年到1996年在中国举办的全国和国际会议倡导生物学的系统科学方法，并提出系统医药学、系统遗传学和系统生物工程概念，在组织1996年第1届国际转基因动物学术研讨会的国际通信（包括时在分子生物技术系的Hood院士）和大会讲演上，以及1999年建立Biosystem Network网站和筹备国际协会和会议的大规模通信（包括与Kitano同为e-Cell课题组的Tomita教授），阐述了系统生物科学与工程的现代概念和方法体系。

明显可见 – 现代系统生物学与医学的典型形态：

1）整合（integrative）与系统生物学词汇互用，合成与建构（constructive）生物学词汇互用；

2）系统科学理论和实验、计算（computational）与工程方法的生物系统与人工生物系统研究概念；

3）生物节律（oscillation）和时间调控为合成生物学研究核心，微电子学与转基因的分子电路图模式；

4）图论、网络拓扑学等方法和三角形、五行图、阴阳或耦合（如系统与合成）或转化概念和符号（典型东方特征）；

5）生物系统科学与工程（BSSE）的概念由传统的过程工程、农业科学概念转换到系统与合成生物学的概念；

6）科学研讨会与艺术画展结合的学术会议与展览模式，等等。

比如

-  http://www.princeton.edu/cbe/people/faculty/brynildsen/group/

-  http://jn.nutrition.org/content/141/3/512/F1.expansion.html

-  http://www.nature.com/nrg/journal/v5/n4/fig_tab/nrg1317_F3.html

注*：

西雅图系统生物学研究所胡德（Hood）院士至今未见提及1968年的“systems biology”不知为何故？

（另，2005年北野宏明和胡德的论文第1作者Ideker都已声明是分子层面的重新提出，胡德、北野宏明都于1999年采用“systems biology”）

以1999年-2000年为起点，同时和平行形成5个学派，包括“omics”学派（G.Church, R. Aebersold等组学实验方法），而1996年-2000年国际规模通讯形成的趋势是基础。