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系统生物学概念辨析

已有 2359 次阅读 2016-9-23 22:26 |个人分类:科学与历史|系统分类:科普集锦| 系统生物学, 合成生物学

瑞士,仍然可见约中古代可能来源于中国的水车,据西方文献,荷兰的风车来源于中亚。瑞士和荷兰是欧洲近现代文明发展的轴线,中欧是东方技术传入欧洲的重要门径。

1999年BjZeng联系瑞士,原想把协会建立在那里,2007年ETH成立了D-BSSE(系统与合成生物学定义)研究中心。1999年到2007年,恰是国际学术共同体建立了起来,进入常规科学时期。2007年英国院士、BjZeng同时分别提出将导致新的工业革命,同年美国贝克利大学成功在酵母表达青蒿素。

美国MIT大学的合成生物学中心,系统生物工程 - 1994年BjZeng提出和1996年在国际上倡导,即,实际上的合成生物学是工程方法的系统生物学范式。国际上,一般以1999年(BjZeng元月建立Biosystem network和10月L.Hood、12月H.Kitano分别注册系统生物学域名)为系统与合成生物学的起点。

1996年BjZeng任秘书长组织国际转基因动物学术研讨会与筹备国际转基因协会。由于,1994年已经把转基因技术转换到了系统生物工程(合成生物学的定义);因而,1999年筹备的是系统生物科学与工程(BSSE)等。国际转基因技术学会,则是2006年西班牙成立了,刊物仍是1996年BjZeng联系的刊物,目前,学会移到了美国,并2013年在广州(中山大学和南方医科大学)举办了国际会议。

系统概念不同于全息概念,没有完全相同的两片树叶,差异性的存在,恰恰是存在的本质,即,1983年BjZeng的“结构论”逻辑学起点,在1992-1994年*成为系统生物科学与工程的理论基础。

2000年合成生物学的化学合成人工DNA分子概念,2001年系统生物学的数学理论与计算机模拟概念,都被重新提出;然而,20世纪90年代,已有多肽核酸和之前人工合成各类生物分子的研究,正是探究了这些领域,以及各类系统理论、进化理论和计算机建模方法等,BjZeng发现存在的缺陷 - 解决不了生物系统机制的揭示和人工生物系统的工程设计等问题。

从而,即,理论生物学与分子生物学在分子细胞生物系统 - 细胞信号传导、基因调控与分子表达谱等层面的交叉与综合学科,提出生物系统理论的计算生物学与实验生物学结合,包括工程方法的生物系统等研究体系。

1)系统医学[1]的概念辨析:在中西医学比较研究和系统科学、分子医学的交叉层面提出,却不同于中医学,也不同于医学的系统科学,而是建立在实验或实证医学– 即,循证医学的基础上,也是数据整合的医学,属于系统与合成生物学的应用。

2)系统生物学[2]的概念辨析:在生物系统的科学与工程偶合层面提出,生物系统理论、实验生物学与计算生物学结合的生物系统研究,包括,数学与计算生物学、纳米与化学生物学等方法与技术。

3)系统遗传学[3]概念辨析:在生理学与遗传学的交叉层面提出,“基因型-表现型”复杂系统的非线性细胞发生(进化-发育)动力学研究,包括,图论与网络拓扑学与分子差异表达谱分析等。

4)合成生物学[4]概念辨析:在转基因技术与细胞仿生工程交叉层面提出,人工生物系统的工程生物学或工程方法的系统生物学研究,也即系统生物工程[5],涉及细胞的仿生工程、转基因禽类输卵管生物反应器[6],包括,太阳能-生物电子技术与计算机辅助设计等。

注: *结构论引用了1968年系统理论概念[2]和1910年化学合成概念[4]相关文献日本、德国已经分别成立了国际学会与协会术语[1、3、5]和[6]为BjZeng于1992年-1994年提出。

-(1996年-2016年20周年纪念)-



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