系统与合成生物学的建立，本身就是交叉与综合的体系化科学，包括，系统与计算机科学、纳米与微电子科学和生物与工程科学等构成，导致的一对偶合学科的系统涌现现象。

1）1992年之前，只有理论生物学和分子生物学，系统生物学[1]术语出现在1968年、1993年[2]和系统生物医学词汇出现在1992年[3]，都不是现在整合理论、实验与计算生物学方法的概念。

2）2000年之前，合成生物学术语的出现，只有1910年[4]、2000年化学合成和1974年、1980年DNA重组的基因工程概念，都不是现在转换到工程方法的系统生物学范式。

3）系统生物学，也不是D.Nobel论述的1865年贝尔纳生理学概念，而是生理学与遗传学交叉而在分子细胞生物学层面的整合，也不是1992年之前的生态系统、器官系统和生物化学代谢系统的控制论等。

4）系统生物学的方法与技术，包括，理论的数学、计算与网络生物学和实验的纳米、化学与合成（最始的概念）生物学等，L.Hood论述的组学（分子生物技术与仪器）生物学[5]和H.Kitano计算生物（生物信息技术与软件）学[6]，并不等于系统生物学，也不是仪器技术开发的学科综合概念。

5）系统遗传学是非线性系统动力学，却不等于数量与统计遗传学的数量叠加概念，也不等同于表观遗传学的基因修饰概念，而是研究生物进化与发育的基因相互作用与生物系统机制，不是孟德尔遗传学的单基因与基因组合等模式。

6）作为国际系统与合成生物学最初的L.Hood和H.Kitnao及其它学派等，都在1999年之前不见相关系统生物学术语的文字记载，1992年-1999年只有BjZeng涉及到系统与合成生物学的相关词汇。

注：在结构论，1994年、1999年BjZeng同时引用与[1]、[4]相关文献，国际上，2008年BjZeng首次提到[2]、[3]的文献，D.Nobel批驳了把功能基因组学或生物信息学等同于系统生物学的概念。