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R语言加速

已有 4016 次阅读 2015-5-5 21:26 |个人分类:Bioinformatics|系统分类:科研笔记| Rcpp

发现不少人写了介绍:

英文版:

http://www.r-bloggers.com/faster-higher-stonger-a-guide-to-speeding-up-r-code-for-busy-people/

中文版:

http://www.seekingqed.com/programming/r/accelerate_r

 

总结一下:

运行速度,Rcpp> Parallel Processing> compiler

编程所花时间,也是这个顺序。


试了一下Rcpp,其实比较简单

这里有不少模板,和R语言很相似。

http://adv-r.had.co.nz/Rcpp.html


compiler最简单,但是对已经向量化的方程没多少提高。

library(compiler)

cmp_function=cmpfun(test_function)


 





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