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提醒:
由于leafshapes内置算法和参数与leafshapes1.0 和leafshapes2.0完全不同,如下操作仅针对leafshapes3.0。leafshapes2.0不同像素范围给定特定的参数,对有些像素不适用,初步发现50像素和600像素的分析效果最佳,适用于各种格式扫描图。而leafshapes3.0只是一种通用算法的尝试。主要用于对leafshapes2.0的更新和结果的调试。(本文属工作笔记。操作细节可供使用leafshapes2.0的同志参考。leafshapes2.0只需采用“Office Mode”进行叶片扫描即可!)
1 工具
1)直尺;
2)坐标纸;
3)铅笔;
4)扫描仪(EPSON EXPRESSION 10000XL);
5)电脑一台,安装扫描软件和Leafshapes3.0。
2材料准备
1)待测叶片N张。
3操作前准备
1)用干净的湿润的棉布将叶片表面擦拭干净待用;
2)用专业的纸巾和清洁液将扫描仪的玻璃面和白色背景色面擦拭干净,若扫描仪不能清除的有大面积污点的则不可使用,可自备一张洁白无效的白纸作为扫描背景色。
4标准叶片扫描图的准备
1)确定该物种一张形态标准的叶片作为标准叶片;
2)将标准叶片放入干净的扫描仪中准备扫描,叶片正面朝下;
3)扫描初始参数设置:【model】选择“专业扫描(Professional Mode)”,【Document Type】选择“Reflective”,【Document Source】选择“Document Table”, 【Auto Exposure Type】选择“Photo”,【Image Type】选择“24-bit Color”,【Resolution】选择“50”-“2400”,【Document Size】默认为“309.9mm*436.9mm”,【Target Size】根据叶片大小选择,此处我们设为最小值50%,即“154.9mm*218.4mm”,其他的保持默认设置;
4)点击【Preview】,预览叶片放置的位置是否合理,判断标准:主叶脉于Y轴尽量平行,叶片放置于纸张的中间最佳。
5)重新确定设置,然后点击【Scan】;
6)设置扫描图片输出参数:【Location】选择指定输出文件夹,【File Name】设置名字按照“物种名-像素(4位数)-扫描件编号(3位数)”编写,【Image Format】选择“Multi-TIFF(*.tif)”,其他参数默认设置。
7)开始扫描。
8)完成后点“Save File”
5标曲与矫正函数
1)基于坐标纸,测定叶长、叶宽、叶面积和叶周长作为标准。
2)使用leafshapes3.0分析,点击【菜单栏】的【"TIF"叶相图全自动批量分析】按钮,选择图片存放的文件夹,开始全自动分析。
3)等待,等待时间由分析电脑内存大小和待测量叶片的数据量所决定。
4)完成分析后,文件夹内每一张原始图片都会出现3个同名不同格式的图像文件。jpg格式是数据可视化表达、bmp格式是分形维数确定图,png格式为叶长和叶宽的行列变化规律。此外还有两个xls文件,他们是所有分析结果的数据列表和幂函数拟合函数的系数列表。
5)选择能代表叶长和叶宽的指标。
6)将分析数据对分析像素进行拟合,确定每个参数的修正函数。
7)将实测数据带入拟合公式中确定最适宜扫描分辨率。
6待测叶片的准备和分析
1)根据计算出的最接近最适宜扫描分辨率,设定扫描仪的扫描分辨率,按照标准叶片扫描图的准备的方法准备待测叶片。
2)使用leafshapes3.0分析,点击【菜单栏】的【"TIF"叶相图全自动批量分析】按钮,选择图片存放的文件夹,开始全自动分析。
3)将计算至带入修正函数计算出准确的拟合值。
建议:下图是在CPUi5,16G内存的电脑下运行leafshapes3.0全自动分析的结果。如果文件夹中含2400万dpi的扫描图时,死机;不含2400万扫描像素,运算时间2.5分钟左右。
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