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博文

基因编辑技术国际研究进展与文献分析报告

已有 3232 次阅读 2016-8-15 13:57 |个人分类:信息分析|系统分类:观点评述

国际研究进展与参考文献:

盘点基因编辑新利器
CRISPR-Cas9技术的局限性促使研究人员寻找替代方法

http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2016/8/353643.shtm

Beyond CRISPR: A guide to the many other ways to edit a genome

The popular technique has limitations that have sparked searches for alternatives.

http://www.nature.com/news/beyond-crispr-a-guide-to-the-many-other-ways-to-edit-a-genome-1.20388

References
  1. Ran, F. A. et al. Nature 520, 186191 (2015).

    Show context
  2. Nelson, C. E. et al. Science 351, 403407 (2016).

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  3. Tabebordbar, M. et al. Science 351, 407411 (2016).

    Show context
  4. Kim, D. et al. Nature Biotechnol. http://dx.doi.org/10.1038/nbt.3609 (2016).

    Show context
  5. Kleinstiver, B. P. et al. Nature Biotechnol. http://dx.doi.org/10.1038/nbt.3620 (2016).

    Show context
  6. Abudayyeh, O. O. et al. Science 353, aaf5573 (2016).

    Show context
  7. Komor, A. C., Kim, Y. B., Packer, M. S., Zuris, J. A. & Liu, D. R. Nature 533, 420424 (2016).

    Show context
  8. Nishida, K. et al. Science http://dx.doi.org/10.1126/science.aaf8729 (2016).

    Show context
  9. Gao, F. et al. Nature Biotechnol. 34, 768773 (2016).

    Show context



PUBMED文献数据库CRISPR-Cas9技术研究论文1722篇分布如下:

数据来源  http://www.pubmedplus.cn/


年份年份趋势图
记录数
占%
01.2016     792 48.980%
02.2015     662 40.940%
03.2014     262 16.203%
04.2013     43 2.659%
期刊期刊分区中科院期刊分区
记录数
占%
01.sci rep     119 7.359%
02.plos one     66 4.082%
03.nucleic acids res     48 2.968%
04.nat biotechnol     35 2.165%
05.nat commun     31 1.917%
06.proc natl acad sci u s a     30 1.855%
07.cell rep     29 1.793%
08.oncotarget     29 1.793%
09.genetics     26 1.608%
10.methods mol biol     25 1.546%
11.nature     25 1.546%
12.yi chuan     21 1.299%
13.cell     20 1.237%
14.mol ther     20 1.237%
15.cell stem cell     18 1.113%
16.j biol chem     18 1.113%
17.j genet genomics     18 1.113%
18.science     17 1.051%
19.cell res     15 0.928%
20.development     14 0.866%
21.genome biol     13 0.804%
22.genome res     13 0.804%
23.int j mol sci     13 0.804%
24.acs synth biol     12 0.742%
25.biochem biophys res commun     12 0.742%
26.j virol     12 0.742%
27.mol cell     12 0.742%
28.nat methods     12 0.742%
29.g3 (bethesda)     11 0.680%
30.plant cell rep     11 0.680%
31.febs j     10 0.618%
32.hum gene ther     10 0.618%
33.j biotechnol     10 0.618%
34.biotechnol bioeng     9 0.557%
35.dev biol     9 0.557%
36.methods enzymol     9 0.557%
37.mol plant     9 0.557%
38.plant biotechnol j     9 0.557%
39.am j hum genet     8 0.495%
40.appl environ microbiol     8 0.495%
41.front plant sci     8 0.495%
42.j vis exp     8 0.495%
43.mbio     8 0.495%
44.methods cell biol     8 0.495%
45.mol ther nucleic acids     8 0.495%
46.biol open     7 0.433%
47.biotechnol j     7 0.433%
48.elife     7 0.433%
49.genes dev     7 0.433%
50.hum mol genet     7 0.433%
国家国家分布图
记录数
占%
01.中国大陆     353 21.831%
02.美国     287 17.749%
03.日本     53 3.278%
04.德国     34 2.103%
05.英国     31 1.917%
06.荷兰     17 1.051%
07.法国     13 0.804%
08.加拿大     11 0.680%
09.丹麦     10 0.618%
10.澳大利亚     8 0.495%
11.瑞典     8 0.495%
12.中国台湾     7 0.433%
13.意大利     7 0.433%
14.瑞士     7 0.433%
15.韩国     7 0.433%
16.比利时     5 0.309%
17.奥地利     4 0.247%
18.西班牙     4 0.247%
19.新加坡     3 0.186%
20.沙特阿拉伯     3 0.186%
21.印度     2 0.124%
22.尼日利亚     2 0.124%
23.挪威     2 0.124%
24.阿拉伯联合酋长国     2 0.124%
25.中国香港     1 0.062%
26.以色列     1 0.062%
27.伊朗     1 0.062%
28.俄罗斯     1 0.062%
29.土耳其     1 0.062%
30.格林纳达     1 0.062%
31.波兰     1 0.062%
32.菲律宾     1 0.062%
33.葡萄牙     1 0.062%
34.阿曼     1 0.062%
大陆城市境外城市
记录数
占%
01.马萨诸塞州剑桥市     88 5.442%
02.美国麻省剑桥市     51 3.154%
03.美国波士顿     45 2.783%
04.la jolla     23 1.422%
05.美国纽约     19 1.175%
06.美国伯克利     15 0.928%
07.英国剑桥市     15 0.928%
08.日本东京     14 0.866%
09.美国旧金山     14 0.866%
10.worcester.us     13 0.804%
11.美国圣迭戈     12 0.742%
12.美国贝塞斯达     12 0.742%
13.hinxton     11 0.680%
14.英国伦敦     11 0.680%
15.munich     10 0.618%
16.日本京都     10 0.618%
17.法国巴黎     10 0.618%
18.美国达勒姆     10 0.618%
19.德国海德堡     9 0.557%
20.日本吹田     9 0.557%
21.日本大阪     9 0.557%
22.日本广岛     9 0.557%
23.美国亚特兰大     9 0.557%
24.美国费城     9 0.557%
25.ames     8 0.495%
26.athens.ga     8 0.495%
27.威斯康星州麦迪逊市     8 0.495%
28.日本筑波     8 0.495%
29.美国巴的摩尔     8 0.495%
30.英国牛津     8 0.495%
31.荷兰乌得勒支     8 0.495%
32.horsholm     7 0.433%
33.nuffield     7 0.433%
34.state university     7 0.433%
35.加拿大蒙特利尔     7 0.433%
36.帕拉托市(斯坦福大学)     7 0.433%
37.戴维斯(加州大学戴维斯分校)     7 0.433%
38.美国雅典     7 0.433%
39.kettering.us     6 0.371%
40.munchen     6 0.371%
41.德国慕尼黑     6 0.371%
42.美国伊萨卡     6 0.371%
43.美国休斯敦     6 0.371%
44.美国圣路易     6 0.371%
45.bar harbor     5 0.309%
46.lincoln.ne     5 0.309%
47.north     5 0.309%
48.radcliffe     5 0.309%
49.section     5 0.309%
50.lincoln.us     5 0.309%
大陆作者作者与主题词全部作者作者邮件
记录数
占%
01.Wang Y     48 2.968%
02.Zhang Y     45 2.783%
03.Chen Y     31 1.917%
04.Liu Y     31 1.917%
05.Zhang X     30 1.855%
06.Zhang L     29 1.793%
07.Zhang F     27 1.670%
08.Li Y     26 1.608%
09.Wang H     26 1.608%
10.Wang J     24 1.484%
11.Wang X     24 1.484%
12.Huang X     23 1.422%
13.Li Z     22 1.361%
14.Li S     21 1.299%
15.Liu J     21 1.299%
16.Li J     20 1.237%
17.Zhao Y     20 1.237%
18.Chen X     19 1.175%
19.Li L     18 1.113%
20.Li M     18 1.113%
21.Zhang J     18 1.113%
22.Kim JS     17 1.051%
23.Wang L     17 1.051%
24.Zhang H     17 1.051%
25.Zhang Z     17 1.051%
26.Shen B     16 0.989%
27.Xu J     16 0.989%
28.Yamamoto T     16 0.989%
29.Yang Y     16 0.989%
30.Zhang B     16 0.989%
31.Doudna JA     15 0.928%
32.Gersbach CA     15 0.928%
33.Huang Y     15 0.928%
34.Li H     15 0.928%
35.Sakuma T     15 0.928%
36.Yang S     15 0.928%
37.Zhou J     15 0.928%
38.Guo X     14 0.866%
39.Huang J     14 0.866%
40.Li W     14 0.866%
41.Liu Z     14 0.866%
42.Wang F     14 0.866%
43.Wang Z     14 0.866%
44.Wu Y     14 0.866%
45.Chen L     13 0.804%
46.Liu H     13 0.804%
47.Wang D     13 0.804%
48.Lai L     12 0.742%
49.Li C     12 0.742%
50.Zhang W     12 0.742%
大陆机构第一作者机构合著机构境外机构
记录数
占%
01.哈佛医学院     64 3.958%
02.加州大学     43 2.659%
03.哈佛大学     37 2.288%
04.霍华德·休斯医学研究所     34 2.103%
05.麻省理工学院     24 1.484%
06.波士顿儿童医院     22 1.361%
07.麻省总医院     17 1.051%
08.牛津大学     16 0.989%
09.东京大学     15 0.928%
10.威斯康星大学     14 0.866%
11.杜克大学医学中心     14 0.866%
12.加州大学伯克利分校     12 0.742%
13.劳伦斯伯克利实验室(lbl)     12 0.742%
14.广岛大学     12 0.742%
15.华盛顿大学     11 0.680%
16.杜克大学     11 0.680%
17.杜克大学医院     11 0.680%
18.内布拉斯加大学     10 0.618%
19.埃默里大学     10 0.618%
20.斯坦福大学     10 0.618%
21.美国加州大学圣地亚哥分校     10 0.618%
22.马萨诸塞大学     10 0.618%
23.京都大学     9 0.557%
24.德克萨斯大学     9 0.557%
25.北卡罗来纳大学     8 0.495%
26.威斯康星 - 麦迪逊大学     8 0.495%
27.宾夕法尼亚大学     8 0.495%
28.日本理化学研究所     8 0.495%
29.明尼苏达大学     8 0.495%
30.海德堡大学     8 0.495%
31.约翰霍普金斯大学     8 0.495%
32.贝勒医学院     8 0.495%
33.丹麦技术大学     7 0.433%
34.北卡罗来纳大学教堂山分校     7 0.433%
35.华盛顿大学医学院     7 0.433%
36.布莱根妇女医院     7 0.433%
37.德克萨斯大学西南医学中心     7 0.433%
38.美国德州大学西南医学中心     7 0.433%
39.佛罗里达大学     6 0.371%
40.大阪大学     6 0.371%
41.威尔康乃尔医学院     6 0.371%
42.布鲁斯堡大学     6 0.371%
43.法国国家健康医学研究院     6 0.371%
44.洛克菲勒大学     6 0.371%
45.爱荷华大学     6 0.371%
46.纪念斯隆-凯特琳癌症中心     6 0.371%
47.georgia institute of technology and emory university     5 0.309%
48.乌得勒支大学     5 0.309%
49.乔治亚理工学院     5 0.309%
50.内布拉斯加大学医学中心     5 0.309%
主题词主题词搭配主题词与主题词
记录数
占%
01.crispr-cas systems     330 20.408%
02.clustered regularly interspaced short palindromic repeats     251 15.523%
03.genetic engineering     193 11.936%
04.base sequence     146 9.029%
05.molecular sequence data     115 7.112%
06.gene targeting     112 6.926%
07.rna, guide     108 6.679%
08.genome     101 6.246%
09.mutation     99 6.122%
10.cell line     81 5.009%
11.crispr-associated proteins     79 4.886%
12.endonucleases     77 4.762%
13.rna editing     66 4.082%
14.gene knockout techniques     64 3.958%
15.mutagenesis     54 3.340%
16.gene expression regulation     46 2.845%
17.genetic vectors     46 2.845%
18.hek293 cells     46 2.845%
19.genetic therapy     44 2.721%
20.genome, human     44 2.721%
21.dna     40 2.474%
22.genomics     38 2.350%
23.plasmids     37 2.288%
24.cell line, tumor     36 2.226%
25.cells, cultured     36 2.226%
26.gene knock-in techniques     35 2.165%
27.phenotype     34 2.103%
28.bacterial proteins     33 2.041%
29.deoxyribonucleases     32 1.979%
30.dna-binding proteins     30 1.855%
31.rna, messenger     30 1.855%
32.homologous recombination     29 1.793%
33.zebrafish     29 1.793%
34.animals, genetically modified     28 1.732%
35.caspase 9     28 1.732%
36.genetic loci     28 1.732%
37.alleles     27 1.670%
38.dna breaks, double-stranded     27 1.670%
39.models, genetic     27 1.670%
40.rna     27 1.670%
41.embryonic stem cells     26 1.608%
42.mice, inbred c57bl     26 1.608%
43.caenorhabditis elegans     25 1.546%
44.reproducibility of results     25 1.546%
45.transcription factors     25 1.546%
46.cell differentiation     24 1.484%
47.gene deletion     24 1.484%
48.gene expression     24 1.484%
49.induced pluripotent stem cells     24 1.484%
50.promoter regions, genetic     24 1.484%
Substance化学药中药
记录数
占%
01.rna, guide     108 6.679%
02.crispr-associated proteins     79 4.886%
03.endonucleases     77 4.762%
04.dna     40 2.474%
05.bacterial proteins     33 2.041%
06.deoxyribonucleases     32 1.979%
07.dna-binding proteins     30 1.855%
08.rna, messenger     30 1.855%
09.caspase 9     28 1.732%
10.rna     27 1.670%
查看更多
疾病症状治疗方法物种解剖食品
记录数
占%
01.肿瘤     108 6.679%
02.感染     60 3.711%
03.扭伤与劳损     42 2.597%
04.先天性遗传性疾病     24 1.484%
05.dna损伤     18 1.113%
06.免疫缺陷综合征     18 1.113%
07.癌,肿瘤     18 1.113%
08.肌营养不良     15 0.928%
09.肝炎     15 0.928%
10.细胞转化, 肿瘤     13 0.804%
11.杜氏肌营养不良     12 0.742%
12.肝炎, 乙型     12 0.742%
13.病毒性疾病     11 0.680%
14.腺癌     11 0.680%
15.肺癌     10 0.618%
16.先天性遗传性新生儿疾病和畸形     9 0.557%
17.白血病     9 0.557%
18.血液和淋巴系统疾病     9 0.557%
19.动物疾病模型     8 0.495%
20.肝细胞癌     8 0.495%
21.肿瘤转移     8 0.495%
22.获得性免疫缺陷综合征     8 0.495%
23.动物疾病     7 0.433%
24.淋巴瘤     7 0.433%
25.疟疾     7 0.433%
26.神经系统疾病     7 0.433%
27.慢性肝炎     6 0.371%
28.乳腺癌     6 0.371%
29.免疫系统疾病     6 0.371%
30.呼吸道疾病     6 0.371%
31.急性髓细胞白血病     6 0.371%
32.肺疾病     6 0.371%
33.髓样白血病     6 0.371%
34.hiv感染     5 0.309%
35.β-地中海贫血     5 0.309%
36.不育     5 0.309%
37.创伤和损伤     5 0.309%
38.呼吸道癌     5 0.309%
39.地中海贫血     5 0.309%
40.慢性乙型肝炎     5 0.309%
41.结直肠癌     5 0.309%
42.肉瘤     5 0.309%
43.肌疾病     5 0.309%
44.胶质母细胞瘤     5 0.309%
45.胸部癌     5 0.309%
46.营养与代谢疾病     5 0.309%
47.血液病     5 0.309%
48.阿尔茨海默病     5 0.309%
49.传染病     4 0.247%
50.单纯疱疹     4 0.247%
科室学科
记录数
占%
01.生物学     196 12.121%
02.医学遗传学     47 2.907%
03.肿瘤学     37 2.288%
04.妇产科学     23 1.422%
05.化学     19 1.175%
06.医学生物化学与分子生物学     18 1.113%
07.病原生物学     17 1.051%
08.药学     16 0.989%
09.病毒学     13 0.804%
10.儿科学     12 0.742%
11.生理学     12 0.742%
12.医学组织工程学     11 0.680%
13.消化病学     11 0.680%
14.精神病与精神卫生学     11 0.680%
15.传染病学     10 0.618%
16.人体解剖与组织胚胎学     9 0.557%
17.免疫学     9 0.557%
18.寄生虫学     8 0.495%
19.病理学与病理生理学     8 0.495%
20.泌尿外科学     7 0.433%
21.临床检验诊断学     6 0.371%
22.内分泌学     6 0.371%
23.血液病学     6 0.371%
24.毒理学     5 0.309%
25.皮肤性病学     5 0.309%
26.中医学     4 0.247%
27.康复医学     4 0.247%
28.心血管病学     4 0.247%
29.男科学     4 0.247%
30.神经病学     4 0.247%
31.神经科学     4 0.247%
32.移植     4 0.247%
33.骨外科学     4 0.247%
34.普通外科学     3 0.186%
35.眼科学     3 0.186%
36.神经外科学     3 0.186%
37.耳鼻咽喉科学     3 0.186%
38.营养与食品卫生学     3 0.186%
39.医学技术     2 0.124%
40.少儿卫生与妇幼保健学     2 0.124%
41.老年医学     2 0.124%
42.肾脏病学     2 0.124%
43.劳动卫生与环境卫生学     1 0.062%
44.口腔医学     1 0.062%
45.周围性血管疾病     1 0.062%
46.放射医学     1 0.062%
47.流行病与卫生统计学     1 0.062%
48.风湿与免疫病学     1 0.062%
49.麻醉学     1 0.062%





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