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肿瘤基因图谱(TCGA)计划文献分析报告

已有 3544 次阅读 2016-6-21 15:36 |个人分类:信息分析|系统分类:科研笔记


The Cancer Genome Atlas(TCGA)癌症基因组图谱是企图全面的并列的去努力地加速理解癌症的分子基础,它通过利用包括大规模基因组测序的基因组分析技术来实现。TCGA的总体目标是提高我们对癌症的诊断、治疗和预防的能力。为了以科学严谨的方式达到这个目标,美国国立癌症研究所(National Cancer Institute NCI)和美国国立人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute NHGRI)用分阶段的策略来启动TCGA。试点项目开发并测试了系统地探究人类20多种癌症中全基因组图谱的改变所需的研究框架。

癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)计划简介http://mp.weixin.qq.com/s?src=3&timestamp=1466487976&ver=1&signature=LnBGiniY3DvcvArqVeR2zrhnE2TdmShpo0GszbjLEcJFFtV0KvnvGoyHZGQ5uGQZBWanWzHSlaSDiSvv0ijgZEBjRoAEksheYdjqMcoJ9m6L5Eumj6tEfNzTRUuoQNJLc4LmQAnN77BO8q-DNCA8lQ==

       肿瘤基因图谱(TCGA)计划国际研究期刊影响因子20以上;H指数100以上的科研成果论文49篇分布如下:可以看到肿瘤基因图谱(TCGA)计划研究的国际名人、名刊、名文。肿瘤研究人员应该关注这些国际一流论文。

数据来源 http://www.pubmedplus.cn/


年份年份趋势图
记录数
占%
01.2016     6 12.245%
02.2015     11 22.449%
03.2014     7 14.286%
04.2013     16 32.653%
05.2012     1 2.041%
06.2011     1 2.041%
07.2010     4 8.163%
08.2009     1 2.041%
09.2008     2 4.082%
期刊期刊分区中科院期刊分区
记录数
占%
01.nature     13 26.531%
02.nat genet     11 22.449%
03.cancer cell     8 16.327%
04.cell     5 10.204%
05.nat med     5 10.204%
06.n engl j med     3 6.122%
07.lancet oncol     1 2.041%
08.nat biotechnol     1 2.041%
09.nat methods     1 2.041%
10.science     1 2.041%
国家国家分布图
记录数
占%
01.美国     27 55.102%
02.中国大陆     3 6.122%
03.丹麦     1 2.041%
04.德国     1 2.041%
05.西班牙     1 2.041%
大陆城市境外城市
记录数
占%
01.上海市     2 4.082%
02.江苏省南京市     1 2.041%
大陆作者作者与主题词全部作者作者邮件
记录数
占%
01.Getz G     7 14.286%
02.Ding L     6 12.245%
03.Lawrence MS     5 10.204%
04.Liang H     5 10.204%
05.Meyerson M     5 10.204%
06.Mills GB     5 10.204%
07.Wilson RK     5 10.204%
08.Yuan Y     5 10.204%
09.Baylin SB     4 8.163%
10.Hayes DN     4 8.163%
查看更多
大陆机构第一作者机构合著机构境外机构
记录数
占%
01.哈佛医学院     6 12.245%
02.纪念斯隆-凯特琳癌症中心     6 12.245%
03.华盛顿大学     5 10.204%
04.哈佛大学     4 8.163%
05.德克萨斯大学安德森肿瘤中心     4 8.163%
06.贝勒医学院     4 8.163%
07.加州大学     3 6.122%
08.华盛顿大学圣路易斯分校     3 6.122%
09.圣路易斯华盛顿大学     3 6.122%
10.德克萨斯大学     3 6.122%
11.美国丹那法伯肿瘤研究所     3 6.122%
12.俄亥俄州立大学     2 4.082%
13.华盛顿大学医学院     2 4.082%
14.斯坦福大学     2 4.082%
15.美国德州大学md安德森癌症中心     2 4.082%
16.麻省总医院     2 4.082%
17.fred hutchinson癌症研究中心     1 2.041%
18.heidelberg pharma gmbh     1 2.041%
19.yale school of public health     1 2.041%
20.伊利诺斯大学香槟分校     1 2.041%
21.加州大学旧金山分校医学中心     1 2.041%
22.南加州大学     1 2.041%
23.哥本哈根大学     1 2.041%
24.圣保罗大学     1 2.041%
25.圣犹大儿童研究医院     1 2.041%
26.圣犹达儿童研究医院     1 2.041%
27.太平洋西北国家实验室(pnnl)     1 2.041%
28.威尔康乃尔医学院     1 2.041%
29.宾夕法尼亚大学     1 2.041%
30.密歇根大学     1 2.041%
31.密歇根大学医学院     1 2.041%
32.密歇根大学安娜堡分校     1 2.041%
33.布朗大学     1 2.041%
34.布莱根妇女医院     1 2.041%
35.布鲁塞尔自由大学     1 2.041%
36.布鲁斯堡大学     1 2.041%
37.得克萨斯大学奥斯汀分校     1 2.041%
38.德克萨斯大学奥斯汀分校     1 2.041%
39.斯坦福大学医学院     1 2.041%
40.约翰霍普金斯大学     1 2.041%
41.美国加州大学圣地亚哥分校     1 2.041%
42.美国国家环境卫生研究中心     1 2.041%
43.美国国家癌症研究所     1 2.041%
44.美国密西根大学     1 2.041%
45.耶鲁大学     1 2.041%
46.范德比尔特大学医学院     1 2.041%
47.范德比特大学     1 2.041%
48.西奈山伊坎医学院     1 2.041%
49.都灵大学     1 2.041%
50.霍华德·休斯医学研究所     1 2.041%
主题词主题词搭配主题词与主题词
记录数
占%
01.mutation     15 30.612%
02.genome, human     12 24.490%
03.neoplasms     12 24.490%
04.gene expression regulation, neoplastic     11 22.449%
05.genomics     10 20.408%
06.cell line, tumor     8 16.327%
07.gene expression profiling     7 14.286%
08.dna methylation     5 10.204%
09.rna, messenger     5 10.204%
10.signal transduction     5 10.204%
11.cell proliferation     4 8.163%
12.gene dosage     4 8.163%
13.genetic predisposition to disease     4 8.163%
14.glioblastoma     4 8.163%
15.micrornas     4 8.163%
16.molecular targeted therapy     4 8.163%
17.phosphatidylinositol 3-kinases     4 8.163%
18.adenocarcinoma     3 6.122%
19.brain neoplasms     3 6.122%
20.breast neoplasms     3 6.122%
21.computational biology     3 6.122%
22.databases, genetic     3 6.122%
23.lung neoplasms     3 6.122%
24.models, genetic     3 6.122%
25.ovarian neoplasms     3 6.122%
26.proteome     3 6.122%
27.algorithms     2 4.082%
28.antineoplastic agents     2 4.082%
29.cadherins     2 4.082%
30.carcinoma, squamous cell     2 4.082%
31.cell cycle     2 4.082%
32.cell survival     2 4.082%
33.chromatin     2 4.082%
34.colonic neoplasms     2 4.082%
35.cpg islands     2 4.082%
36.dna copy number variations     2 4.082%
37.dna modification methylases     2 4.082%
38.dna mutational analysis     2 4.082%
39.dna repair     2 4.082%
40.dna, neoplasm     2 4.082%
41.gene deletion     2 4.082%
42.genes, p53     2 4.082%
43.genes, tumor suppressor     2 4.082%
44.genetic variation     2 4.082%
45.genome-wide association study     2 4.082%
46.isocitrate dehydrogenase     2 4.082%
47.molecular sequence annotation     2 4.082%
48.oligonucleotide array sequence analysis     2 4.082%
49.oncogenes     2 4.082%
50.phenotype     2 4.082%
Substance化学药中药
记录数
占%
01.rna, messenger     5 10.204%
02.micrornas     4 8.163%
03.phosphatidylinositol 3-kinases     4 8.163%
04.proteome     3 6.122%
05.antineoplastic agents     2 4.082%
06.cadherins     2 4.082%
07.chromatin     2 4.082%
08.dna modification methylases     2 4.082%
09.dna, neoplasm     2 4.082%
10.idh1 protein, human     2 4.082%
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疾病症状治疗方法物种解剖食品
记录数
占%
01.肿瘤     42 85.714%
02.腺和上皮癌     10 20.408%
03.癌,肿瘤     7 14.286%
04.胶质母细胞瘤     7 14.286%
05.神经胶质瘤     6 12.245%
06.乳腺癌     5 10.204%
07.星形细胞瘤     5 10.204%
08.生殖细胞和胚胎性癌     5 10.204%
09.神经上皮癌     5 10.204%
10.神经外胚瘤     5 10.204%
11.神经组织癌     5 10.204%
12.腺癌     5 10.204%
13.乳腺疾病     4 8.163%
14.消化系统疾病     4 8.163%
15.消化系统肿瘤     4 8.163%
16.皮肤与结缔组织疾病     4 8.163%
17.皮肤疾病     4 8.163%
18.肺癌     4 8.163%
19.胃肠疾病     4 8.163%
20.胃肠癌     4 8.163%
21.脑肿瘤     4 8.163%
22.中枢神经系统疾病     3 6.122%
23.中枢神经系统肿瘤     3 6.122%
24.卵巢癌     3 6.122%
25.女性泌尿生殖器疾病     3 6.122%
26.女性泌尿生殖器疾病和妊娠并发症     3 6.122%
27.泌尿生殖系统癌     3 6.122%
28.癌形成过程     3 6.122%
29.白血病     3 6.122%
30.神经系统疾病     3 6.122%
31.神经系统肿瘤     3 6.122%
32.结直肠癌     3 6.122%
33.结肠疾病     3 6.122%
34.肠癌     3 6.122%
35.肠道疾病     3 6.122%
36.脑疾病     3 6.122%
37.内分泌系统疾病     2 4.082%
38.内分泌腺癌     2 4.082%
39.卵巢疾病     2 4.082%
40.女(雌)性生殖器肿瘤     2 4.082%
41.女性生殖器疾病     2 4.082%
42.子宫附件疾病     2 4.082%
43.急性髓细胞白血病     2 4.082%
44.性腺障碍     2 4.082%
45.直肠疾病     2 4.082%
46.细胞转化, 肿瘤     2 4.082%
47.结肠癌     2 4.082%
48.髓样白血病     2 4.082%
49.鳞状细胞癌     2 4.082%
50.黑色素瘤     2 4.082%
科室学科
记录数
占%
01.memorial sloan kettering cancer center     7 14.286%
02.department of medicine     5 10.204%
03.department of systems biology     5 10.204%
04.the university of texas md anderson cancer center     5 10.204%
05.department of bioinformatics and computational biology     4 8.163%
06.department of biostatistics     4 8.163%
07.department of oncology     4 8.163%
08.department of pathology     4 8.163%
09.department of neurological surgery     3 6.122%
10.department of cancer biology     2 4.082%
查看更多




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