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封面故事:液滴与防水表面之间的接触时间
Reducing the contact time of a bouncing drop
本期封面所示为一个水滴落在一只闪光蝶的防水翅膀上。能够保持干燥、有自清洁功能或能防结冰的表面有很多用途。袭击这种表面的液滴往往会展开,然后在最后弹起之前回缩。很多应用都能受益于减小液滴和表面之间的接触时间,这种现象被普遍假设是当撞击的液滴发生对称变形时出现的。现在,Kripa K. Varanasi及同事发现,在一个具有能重新分配液体质量、以使其不再展开和对称回缩的形态的超憎水性表面上,液滴弹开的速度会更快。理论和实验都证实,这种办法能将一个弹起的液滴和一个表面之间的接触时间大大缩短,超过过去被认为可能做到的极限。(doi: 10.1038/nature12740)
非编码RNA阻断DNA甲基化
DNMT1-interacting RNAs block gene-specific DNA methylation
DNA甲基化是与基因表达的沉默相关的一种表观遗传修饰。Daniel Tenen及同事提出,活性转录直接调控DNA甲基化的水平。来自被研究很透彻的甲基化敏感基因CEBPA的一个非编码RNA与DNA甲基转移酶DNMT1相互作用,阻止在CEBPA位点上的甲基化,从而帮助CEBPA表达。DNMT1 和 RNAs之间的功能联系似乎发生在无数基因位点上。这些发现支持认为非编码RNA通过与DNMT1相互作用来参与基因组甲基化模式的调控的假说,同时也为异常DNA甲基化的点特异性改变提出了一个潜在治疗策略。(doi:10.1038/nature12598)详细中文报道
母体-合子过渡的触发因子
Nanog, Pou5f1 and SoxB1 activate zygotic gene expression during the maternal-to-zygotic transition
这篇论文识别出了在胚胎形成过程中负责合子程序的启动的关键因子。在受精之后,母体因子引导发育,并在母体-合子过渡时触发合子基因组的激发。Antonio Giraldez及同事采用“功能丧失”分析、高吞吐量转录组测序和核糖体足迹法识别出了多能因子Nanog、 Pou5f1 和SoxB1在斑马鱼胚胎的合子转录的启动及母方转录体的清除中所起的重要作用。这些发现表明,在胚胎发育机制、多能性的产生和重新编程之间可能存在一个联系。(doi: 10.1038/nature12632)详细中文报道
一种能杀灭persister 细胞的抗生素
Activated ClpP kills persisters and eradicates a chronic biofilm infection
细菌药物反应的双重性质使人们更加担心今天的抗生素应对未来感染的能力。一些细菌会形成遗传抗性,而其他的则会通过形成被称为 “persister”的休眠细胞(在这种细胞中抗生素的酶目标是失活的)而变得具有耐受性,能够在抗生素存在下存活。Kim Lewis及同事进行了搜寻有可能通过破坏这些能量有限的细胞内的目标来杀灭persister 细胞的药物的研究工作。他们发现,acyldepsipeptide抗生素ADEP4能激发ClpP蛋白酶和细胞的蛋白水解机制,通过迫使persister 细胞降解一系列细胞蛋白来杀灭它们。这是一个有潜在重要性的结果,它表明:将ADEP4这样的药物与传统抗生素相结合,有可能为慢性感染的控制提供新的可靠策略。(doi:10.1038/nature12790 & doi: 10.1038/nature12834)详细中文报道
变化条件下的体温控制
The nuclear receptor Rev-erbα controls circadian thermogenic plasticity
除了体温每天的节律性变化外,哺乳动物还能防止它们的核心体温因天气寒冷而降低。这项研究发现,核受体Rev-erbR(一个转录抑制因子)通过对棕色脂肪组织功能的调控,充当节律和生热网络与体温节律性之间的一个联系环节。暴露于低温的小鼠在上午、当Rev-erbR几乎没有表达时要比在下午几点钟、当Rev-erbR很丰富时状况好得多,而且Rev-erbR基因的删除能提高小鼠对寒冷的耐受力。Rev-erbR被发现在棕色脂肪组织中起“去耦合蛋白在在”(Ucp1)的一个生理抑制因子的作用,以此来根据环境情况维持体温节律。(doi:10.1038/nature12642)详细中文报道
HIV怎样躲子弹?
HIV-1 evades innate immune recognition through specific cofactor recruitment
值得注意的是,“人免疫缺陷病毒”(HIV)-1能感染巨噬细胞(检测病原体和促进先天免疫反应的免疫细胞),而又不会刺激先天免疫。现在Greg Towers及同事发现,这取决于能否将特定辅因子引入到HIV-1的衣壳中,这些辅因子参与病毒向细胞核内的进入和定位。当衣壳-辅因子之间的这些相互作用被病毒突变、辅因子耗尽或辅因子引入受到的药理抑制阻止时,病毒DNA就可以被包括环形GMP-AMP合酶在内的先天免疫感应分子检测到。(doi: 10.1038/nature12769 & doi: 10.1038/nature12707)详细中文报道
群体大小影响文化传承
Experimental evidence for the influence of group size on cultural complexity
人类一个重要属性是具有进行文化积淀的能力,即能够将所学到的行为代代相传。理论工作曾经提出,人口规模是文化发展的一个重要因素:人口太少,信息会减少;人口足够多,信息会增加。通过对玩一个实验性文化游戏的若干组志愿者进行研究,Maxime Derex等人发现了支持这一预测的证据。他们显示,在一个重复的过程中,小的组别不能保持完成一项复杂任务的能力或在一项简单任务上提高其表现的能力,而大的组别随着时间推移在完成两种类型任务上的表现都能提高。(doi: 10.1038/nature12774 & doi:10.1038/nature12708)详细中文报道
“线性泛素链”的形成机制
Structural basis for ligase-specific conjugation of linear ubiquitin chains by HOIP
“线性泛素链”是先天免疫和炎症中所涉及的细胞信号作用通道的重要调控因子。这些链是由“E3泛素连接酶”HOIP合成的。在这项研究中,Katrin Rittinger及同事提出了HOIP的催化核心在其apo形式和在与“泛素”形成的复合物中的晶体结构。这些结构为“线性泛素链”通过LUBAC“泛素连接酶”复合物的形成提供了一个机制分析结果。(doi: 10.1038/nature12638)
CO2通过内陆水体的转移
Global carbon dioxide emissions from inland waters
最近几十年人们越来越认识到,内陆水体会将数量相当大的CO2释放到大气中。此前一直难以对全球范围内有多少碳以这种方式被转移做出估计。这项研究将新数据集与系统方法相结合来探讨这一问题,并且估计溪流、江河、湖泊和水库的全球碳排放速度为大约每年2拍克(1拍克=1015克)。由于考虑到了溪流和江河所做贡献,这个数字高于以前的数字。这项新的分析工作还识别出了溪流和江河侵蚀的全球热点:CO2通量的大约70%发生在仅20%的陆地表面。(doi: 10.1038/nature12760 & doi: 10.1038/503346a)
太阳系外行星Kepler-78b的质量和平均密度
An Earth-sized planet with an Earth-like density
A rocky composition for an Earth-sized exoplanet
人们目前已经发现少数几个与地球的大小或质量差不多的太阳系外行星。现在,它们当中一个的大小和质量首次同时被确定。于今年8月被首次描述的Kepler-78b靠近其主星,它绕后者每8.5小时转一圈。两个小组得以能够利用行星和恒星之间的近距离来对Kepler-78b的质量进行多普勒光谱测定。由Andrew Howard 和Francesco Pepe领导的这两个小组采用不同天文望远镜分别对该行星的质量做出了估计,其结果分别为1.69 0.41 和 1.86 +0.38/−0.245个地球质量。他们计算出该行星的平均密度分别为5.3 和5.57 g cm−3,这非常像地球的平均密度,并且说明它具有与地球相似的岩石和铁组成。(doi: 10.1038/nature12768 & doi: 10.1038/nature12702 & doi: 10.1038/nature12767)
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