石云里教授是中国科学技术大学科技史与科技考古系博士生导师。中国科学技术史学会理事，国际科技史学会古代与中世纪天文学委员会执行委员，国际天文学联合会天文学与世界遗产工作组成员，德国图宾根大学中国与韩国研究所客座教授，英国Annals of Science、德国EastAsian Science，Technology and Medicine等专业期刊编委。

首都经济贸易大学出版社2010年1月出版了他的《科学简史》。正如一些批评家所说，撰写科学史的一个前提是，要给“科学”下一个定义。实际上，“什么是科学”存在着很大的争议，基于不同的定义有着不同的历史资料取舍原则。在实证主义者眼里，他们更注重于近现代科学发轫的那个年代，更乐意把它称之为“科学时代”并重墨浓彩；他们把实证精神看成是“科学”的起点，苛刻地要求它能够被客观事实所证实，而对形而上学思维范式实行严格的排拒。

但是，石云里教授着眼于知识的传承，他是这样描述的：“事实上，科学知识是人类意识的产物，是人类利用自己的语言对自然进行的理解和描述。”显然，他这里的“科学知识”等同于自然知识，并非必须科学检验。因此，他接着说：

人们相信它们是真的，是因为人们认为自然的确存在某种秩序或者规律，而且这种秩序或者规律能够为人们所认识、理解，并且是能够加以表达的。这些信念或者信仰说到底都是主观的，都是人的意识投射到自然上的，是一种世界观。这种世界观不仅决定着科学知识的形式和内容，也决定着人们获取自然知识的方式方法（也就是方法论），甚至还决定着人们对于科学知识的价值判断：究竟什么样的自然知识才是好的知识，才是确定的和可靠的知识？从很大的意义上来说，有什么样的世界观，就会产生什么样的科学，并且，随着世界观的重大转变，科学也会发生重要的变化。由于不同的文明具有不同的世界观，同一文明中的世界观也会随着时间而改变。所以科学既具有历史性，又具有文化性。可以说，不同的文明和不同的历史时期都可以有不同的科学。

他的《科学简史》目录如下：

导言：科学及其在西方的历史

1  人、神与天地--自然知识的起源

1.1  原始思维

1.2  尼罗河的赠礼

1.3  两河之间

1.4  爱琴海域

2  本原与真知——希腊自然哲学的开端

2.1  希腊城邦中的知识转变

2.2  寻找本原

2.3  万物皆数

2.4  元素、种子与原子

2.5  变化与知识

3  理念与逻辑--从柏拉图到亚里士多德

3.1  哲学的转向

3.2  两个世界

3.3  几何性的宇宙

3.4  逻辑路线

3.5  宇宙阶梯

3.6  生物链条

3.7  第一推动者

4  几何与自然--希腊的数理科学传统

4.1  迈进希腊化

4.2  《几何原本》

4.3  力学之父

4.4  测量宇宙

4.5  数学天文学

5  身体与灵魂——希腊的医学与生理学

5.1  从神话到理性

5.2  解剖学的发展

5.3  盖伦医学

6  实用与信仰之间——罗马统治下的科学

6.1  罗马人的知识取向

6.2  知识汇编

6.3  爱智与信仰

7  沙漠绿洲——阿拉伯科学的兴起与发展

7.1  穆斯林的知识中兴

7.2  印度数字与代数学

7.3  天文学革新

7.4  重量科学

7.5  光学之父

7.6  炼金大师

7.7  医学圣经

8  雅典的回归——欧洲的学术复兴

8.1  穿越“黑暗”

8.2  翻译运动

8.3  大学与经院哲学

8.4  光学、数学与实验

8.5  牛津算家与冲力论者

9  人是一个奇迹--文艺复兴

9.1  从天堂到尘世

9.2  人文主义与科学复兴

9.3  魔法与自然主义

9.4  艺术与科学

9.5  文艺复兴人——达芬奇

10  为了“和谐”的革命——新宇宙的构建

10.1  日心说的诞生

10.2  宗教上的麻烦

10.3  第谷的调和

10.4  开普勒的“新天文学”

11  上帝的另一部书——科学与宗教的分立

11.1  望远镜引发的争端

11.2  反击“鸽子联盟”

11.3  《对话》与审判

11.4  近代科学家与上帝

12  讯问自然——从经验知识到实验哲学

12.1  炼金家的反叛

12.2  探索人体

12.3  技艺与哲学

12.4  “新工具”

13  宇宙的语言——自然的数学化

13.1  数学挑战哲学

13.2  自然的数学语义

13.3  数学化的哲学与世界

13.4  数学需要实验

14  世界是架时钟——机械论的盛行

14.1  原子与“原因”

14.2  广延、运动和宇宙

14.3  人是机器

14.4  空气是弹簧

14.5  元素之死

15  宫廷与学会——自然知识的新家

15.1  资助者与受托人

15.2  私人社团

15.3  “所罗门宫”与皇家学会

15.4  科学院与国王的光荣

16  苹果与月亮——牛顿的综合

16.1  真理最好的朋友

16.2  解密引力

16.3  《原理》大意

16.4  流数术

16.5  光的“探询”

17  科学与启蒙——牛顿哲学的传播与发展

17.1  关于力的论战

17.2  “万有引力”的证明

17.3  分析力学

17.4  不可称量流体

17.5  “光的世纪”

18  重建元素——近代化学体系的创建

18.1  从微粒到燃素

18.2  “新空气”

18.3  有计划的革命

18.4  原子论的复活

18.5  原子量与周期律

18.6  统一的王国

19  秩序与演进——自然史的新发展

19.1  星云与宇宙

19.2  地神对海王

19.3  生物的谱系

19.4  物种的演进

19.5  地球的革命与均变

20  “乱七八糟定律”——达尔文进化论的建立

20.1  不务正业者的正业

20.2  “秘密中的秘密”

20.3  “恶狗”与“斗犬”

20.4  科学问题

21  场、波与能量——经典物理学的突飞猛进

21.1  从青蛙电到电磁场

21.2  光与电磁波

21.3  能量的科学

22  物质与生命--生物学的深入发展

22.1  细胞联邦

22.2  微生物与达尔文小池

22.3  个体发育

22.4  人与机器狗

23  重构时空——相对论的建立

23.1  捕捉以太

23.2  物理学中的新太阳

23.3  狭义相对论

23.4  广义相对论

24  粒子与波——量子力学的建立

24.1  荒唐的量子

24.2  开启原子

24.3  原子与光谱

24.4  矩阵力学

24.5  波动力学

25  寻找终极——粒子物理与宇宙学

25.1  新炼金术

25.2  解剖原子核

25.3  基本粒子

25.4  宇宙大爆炸

25.5  无尽的挑战

26  生命密码——现代生物学

26.1  发现孟德尔

26.2  两个学派的争论

26.3  果蝇——“上帝的赠礼”

26.4  DNA的“黑暗时代”

26.5  非常“3+1”

26.6  划时代的里程碑

26.7  步入基因时代

后记