生态学家经常需分析重复观测的实验或群落调查。可以使用STI程序包检验空间时间交互作用、空间、时间单独效应的显著性。

程序包这里下载：

https://sites.google.com/site/miqueldecaceres/software

也可以这里下载：

STI_1.0.2.zip

需要安装在R3.0之前的版本。

原理可以参考Pierre的2010 Ecology文章

09-0199%2E1.pdf

其实不必看原理，安装完程序包后（也必须同时安装vegan包)，直接将下列代码拷贝到R工作空间，看一下数据结构和分析结果，就很容易理解。

library(STI)

data(trichoptera)

trichoptera

trich.log = log(trichoptera[,-c(1,2)]+1)

STImodels(trich.log, S=22, T=10, nperm=999, model="5")