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glmm.hp包现在允许分解glmmTMB包得到的marginal R2

已有 2410 次阅读 2022-12-2 09:22 |个人分类:glmm|系统分类:科研笔记

在11月26日水杉生态统计论坛第三讲GLMM专题期间,我简单做了个glmm.hp包的报告。有个听众问glmm.hp是否能分解glmmTMB的包得到的marginal R2?之前,我只考虑了lme4和nlme包得到的模型对象,现在我把glmmTMB得到的模型对象也加到glmm.hp里面来分解。在正式提交给官网CRAN之前,请用glmmTMB做分析的研究人员尝试一下用glmm.hp包分解glmmTMB得到的对象的marginal R2,并诚挚希望能告诉给我结果是否合理,我的邮箱lai@njfu.edu.cn或QQ:185756911联系。

新版glmm.hp暂时放在百度网盘,请大家下载后本地安装,百度网盘链接: https://pan.baidu.com/s/1CMPH7E0CQiRI79cyZVCraQ 提取码: jyde

以下为案例代码:
library(glmm.hp)
library(glmmTMB)
(m2 <- glmmTMB(count ~ spp + mined + (1|site),zi=~spp + mined, family=nbinom2, data=Salamanders))
glmm.hp(m2)

图片




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