R语言林学研究当中的应用分析

为了研究R语言在林学（Forestry）研究论文里面使用情况，我们通过逐篇查阅的方式，分析近5年来（2014-2018）6种SCI林学刊物5518篇研究论文（不包括综述）使用R语言作为数据分析工具的情况。结果表明，林学研究论文使用R语言作为数据分析工具的比例从2014年28.8%增加到2018年41.4%（图1和图2）。从5年平均水平来看，以国际植被学会官方刊物Journal of Vegetation Science最高，达到68%，其次是Forest Ecology and Management，达到46%。比例最低的是Journal of Forestry，比例才6%（图2和图3）。总体上说，刊物之间的差别比较大，偏生态领域的两个刊物比传统林学的刊物使用R比例高不少。

图1.  6种生态学SCI刊物从2014-2018年所发表研究论文使用R语言比例总体变化趋势（基于5518篇文献研究结果）

图2.  6种生态学SCI刊物从2014-2018年所发表研究论文使用R语言比例每种刊物变化趋势

图3  6种生态学SCI刊物从2014-2018年所发表研究论文使用R语言作为数据分析工具比例比较

在这5518篇被调查研究论文中，总共有超过538个R程序包被使用（图4）。使用频次最多10个包是vegan, lme4, nlme, MuMIn, multcomp, MASS, car, mgcv,ggplot2和dpIR。

图4  6种林学SCI刊物从2014-2018年所发表研究论文使用R程序包使用频次排位。

以上内容为2019年4月14日在海南大学召开的第十四届中国林业青年学术年会上的报告：