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约束排序（RDA，CCA）两种筛选环境变量的方法

已有 15750 次阅读 2016-12-26 11:55 |系统分类:科研笔记| 约束排序（RDA

library(vegan)

data(dune)

data(dune.env)

## step基于AIC值

step(cca(dune ~ 1, dune.env), reformulate(names(dune.env)), test="perm")

##ordistep基于P值

ordistep(cca(dune ~ 1, dune.env), reformulate(names(dune.env)), perm.max=200)

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