UIfigure的WindowStyle属性有以下三种

'normal' — 图形窗口独立于其他窗口，在图形显示时可以访问其他窗口。

'modal'— 该图形以正常窗口样式显示在所有现有图形窗口的顶部，只要顶部图形存在并保持模态，就无法访问它们。但是，将显示在模态图之后创建的任何新图。

当存在多个模态窗口时，最近创建的窗口保持焦点并保持在所有其他窗口之上，直到它变得不可见，或者返回到正常的窗口样式，或者被删除。那时，焦点恢复到上次获得焦点的窗口。

'alwaysontop'— 该图形显示在所有其他窗口的顶部，包括模态图形窗口和来自非 MATLAB 应用程序的窗口。其他窗口仍然可以访问。 

将WindowStyle属性设置为normal

则通过程序打开选择文件后，则该顶层显示的窗口会在Windows窗口中置于底层，从matlab2020版本到现在，这个问题一直存在。

将WindowStyle属性设置为alwaysontop

窗口居于顶层，但文件系统打开的弹窗则无法处于最顶层；下图中“请选择指定...”就是窗口打开的文件夹弹窗，但无法居于最顶层。 

通过normal和alwaysontop组合实现app窗口在最上层，组合效果如下，中间函数为打开文件的函数

app.Figure.WindowsStyle = 'normal';

[fileName pathName]=uigetfile/dir (此处为打开文件的函数);

app.Figure.WindowsStyle = 'alwaysontop';