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hg18 and hg19 fasta

已有 5346 次阅读 2015-7-9 09:27 |个人分类:知识点专题|系统分类:科研笔记

http://www.broadinstitute.org/ftp/pub/seq/references/  下载fasta格式

另外可以从ucsc下载,地址 http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg19/bigZips/  下载2bit格式

http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/FOOTER 含有

twoBitToFa 的说明文件

twoBitToFa 需要添加到可执行路径中去

twoBitToFa input.2bit output.fa


其实ucsc有许多有用的utility,http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/

FAQ中也有许多针对性的答案可以借鉴。



https://blog.sciencenet.cn/blog-2609994-904024.html

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