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maftools 找不到对象\'Variant_Classification\'

已有 3258 次阅读 2019-6-12 10:54 |个人分类:全外显子项目|系统分类:科研笔记| 问题

> require(maftools)
载入需要的程辑包:maftools
Registered S3 methods overwritten by 'ggplot2':
  method         from
  [.quosures     rlang
  c.quosures     rlang
  print.quosures rlang
> var.annovar.maf <- annovarToMaf(annovar = "all_annovar3", Center = 'NULL', refBuild = 'hg19',tsbCol = NULL, table = 'refGene',sep="\t",basename = NULL, MAFobj = FALSE, sampleAnno = NULL)
-Reading annovar files
-Processing Exonic variants
--Adding Variant_Classification
--Parsing aa-change
-Processing Non-exonic variants
-Adding Variant_Type
错误: 找不到对象'Variant_Classification'



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