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经常用到的包:
1,tidyverse
tidyverse. 是一个经常使用包的集合,包含 ggplot2(数据可视化), dplyr(数据处理), tidyr(数据清洗), readr(数据导入)等,具体可见:
2,data.table
读取数据比较快,fread函数比较智能,能够自动识别分隔符和有无表头
3,shiny
可以构建可视化的交互界面
4,reshape2
用于数据重塑
命令:
install.packages(c("tidyverse","data.table","shiny","reshape2"))
按照完成后,基本的包都有了,so easy
另外,由于要进行基因组选择相关的分析,我还要安装:synbreed,sommer,MCMCglmm,lme4软件包,安装命令:
install.packages(c("synbreed","sommer","MCMCglmm","lme4"))
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