使用knitr处理Rnw文档

Rnw文档是保存了R代码的Latex文档。人们希望Latex中的R代码可以自动运行， 并将运行结果， 复制到Latex代码中。 同时， 给出绘制的图形等。

例如以下的代码， 是一篇Rnw文档的内容， 将其拷贝， 粘贴到记事本中， 另存为test.Rnw文件即可。 注意编码要选ANSI。

documentclass[CJK]{cctart}

usepackage{verbatim}

title{中文文章里面如何使用knitr？ }

author{张金龙}

begin{document}

maketitle

在本例子中， 我们将演示在R中， 如何调用 hclust() 并且将结果写入 LaTeX{} 文件中:

<<>>=

x<-c(1,2,6,8,11)

dim(x)<-c(5,1)

d<-dist(x)

d

hc<-hclust(d, "single")

dend<-as.dendrogram(hc)

@

绘制的树状图:， 目前，kintr程序包在处理Rnw文档时， 不允许注释中有中文

begin{center}

<<fig=TRUE,echo=FALSE>>=

par(mfrow = c(2, 2),mar = c(4,3,1,2))

plot(dend)

plot(dend, nodePar=list(pch = c(1,NA),

   cex=0.8, lab.cex=0.8), type = "t",

   center=TRUE)

plot(dend, edgePar=list(col = 1:2,

   lty = 2:3), dLeaf=1,

   edge.root = TRUE)

plot(dend, nodePar=list(pch = 2:1,

   cex=.4*2:1, col=2:3),

   horiz=TRUE)

@

end{center}

end{document}

在Rnw文档中， R代码需要放在 <<fig=TRUE,echo=TRUE>>= 和 @ 之间。 其中的代码一定要可以执行。 在后续处理中，R的Sweave函数和knitr程序包中的knitr函数， 都能够生成相应的tex文件， 以及所需要包含的pdf图形。

fig=TRUE 表示， 要包括代码生成的图形； echo=TRUE 表示， 要包括运行结果所生成的代码。

Sweave函数就是为了处理Rnw文件而生的。 但是Sweave在处理中文的Latex文档时， 需要设定的参数很多， 并且常常出错。幸运的是，我们还有谢益辉编写的knitr程序包。

kintr在处理Rnw文档非常方便。 假设Rnw文档放在

C:/Users/Jinlong/Desktop/Sweave

文件夹之下，名为test.Rmw， 则使用以下R代码

setwd("C://Users//USER//Desktop//Sweave") ### 转换到工作目录，

library(kintr) ###导入kintr程序包

knit("test.Rnw")

即可在该目录下， 生成.tex文档， 以及需要包含的文件。

用TexWorks编译成pdf文档即可。

注意：kintr程序包在处理Rnw文档时，R代码的注释中不允许注释中有中文