讲座内容包括：

1 进化树及相关基本概念
2 DNA 序列的获取和比对
3 进化模型及其筛选
4 建立进化树的方法
5 启发式搜索和 bootstrap 可靠性评估
6 贝叶斯法建树
7 分化时间的校对：分子钟
8 通过植物学名建立进化树
9 系统发育多样性分析： ape、 vegan 和 picante

本讲座是2019年9月16日应环保部环境科学研究院的刘勇波副研究员（http://www.craes.cn/zjhky/craes_kydw/sssds/201808/t20180819_454216.shtml）的邀请而准备的，在此特别感谢刘师兄的邀请和热情款待。

特别感谢沈泽昊、张英、杨拓、高芳銮、向小果、刘勇波、俞方圆、曾思金等老师提出宝贵意见！

更多内容敬请关注 http://blog.sciencenet.cn/u/zjlcas 和 https://github.com/helixcn 。

从DNA序列到系统发育多样性--进化树的建立和进化相关分析简介.zip