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目的:介绍使用CASTEP模块的有限位移法计算声子谱的方法。
所用模块:Materials Visualizer、CASTEP
前提条件:利用第一性原理预测AlAs的晶胞参数(Predicting the lattice parameters of AlAs from first principles)教程、预测锗的热力学性质(Predicting the thermodynamic properties of germanium)教程
背景
声子是固体物理中的一个重要概念,可以使用该概念对大量性质进行计算,例如比热、热膨胀、热传导、电子-声子相互作用、电阻系数和超导性等。密度泛函理论(DFT)可以对这些性质进行预测,CASTEP模块中即包含了这些功能。在晶格动力学计算中有两种主要的方法:密度泛函微扰理论(DFPT)和有限位移方法。第一种方法通常比较快速并且更加精确,但较难实现,并且存在一系列的限制。目前,在CASTEP模块中,DFPT方法仅能用于非自旋极化情况,只能使用模守恒赝势。因此,对于大部分各类材料,只能通过有限位移算法进行声子计算。
介绍
在本教程中,将学习如何使用CASTEP模块运行有限位移计算,从而获得磁性金属的声子散射和态密度。
本教程包括如下部分:
开始
优化铁晶胞的结构
计算声子散射谱和态密度(DOS)
显示声子散射和态密度
注意:为了和本教程中的参数保持一致,可以使用Settings Organizer对话框将项目中所有参数都设置为BIOVIA的默认值。
1、开始
首先启动Materials Studio并创建一个新项目。
打开New Project对话框,输入Fe_phonon作为项目名,单击OK按钮。
新项目将以Fe_phonon为项目名显示于Project Explorer中。
首先导入Fe结构,该结构包含在Materials Studio的结构库中。
在菜单栏中选择File | Import...,打开Import Document对话框。导航至Structures/metals/pure-metals文件夹,选择Fe.xsd文件。单击Open按钮。
2、优化铁晶胞的结构
现在,使用CASTEP优化Fe晶胞的几何构型。
在Modules工具条中单击CASTEP按钮后面的下拉箭头,然后从下拉列表中选择Calculation,或从菜单栏中选择Modules | CASTEP | Calculation。
打开CASTEP Calculation对话框。
在Setup选项卡中,把计算任务Task设置为几何优化Geometry Optimization,将精度Quality设置为Fine,将泛函Functional设置为LDA。将自旋极化Spin polarization设置为共线Collinear,取消选择使用默认自旋值作为初始值Use formal spin as initial复选框。设置初始自旋Initial spin值为2。
CASTEP Calculation对话框Setup选项卡
几何优化的默认值不包括对晶胞参数的优化。
单击More...按钮,打开CASTEP Geometry Optimization对话框。从晶胞优化Optimize cell的下拉列表中选择Full,关闭对话框。
在Electronic选项卡,从赝势Pseudopotentials下拉列表中选择OTFG超软赝势OTFG ultrasoft。
在Job Control选项卡,为计算任务设置网关位置Gateway location。
单击More...按钮,打开CASTEP Job Control Options对话框,取消选择实时升级Live updates部分的所有选项,关闭对话框。
单击Run按钮运行计算任务。
注意:如果在具有大量内存(例如总共超过10 GB)的集群上运行此计算,则应在Runtime optimization中选择Speed。
计算完成后,结果将呈现在名为Fe CASTEP GeomOpt的新文件夹中。
【系列教程】
Adsorption Locator模块——定位SO2分子在Ni(111)表面的吸附位置【1】
Amorphous Cell模块——演示如何将分子填充到现有结构中【1】
CASTEP模块——利用第一性原理预测AlAs的晶胞参数【1】
Materials Studio是久负盛名计算模拟软件,问世20余年来,经过不断地迭代优化,使其功能异常强大,极易上手,初学者只需通过简单的参数设置和点击鼠标就能完成DFT计算。其计算可靠性久经考验,备受Nature、Science等顶级期刊认可。
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