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Materials Studio入门到精通【9】关于超晶胞的问题

已有 10771 次阅读 2021-4-12 15:34 |个人分类:科研干货|系统分类:科研笔记

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Materials Studio入门到精通【9】关于超晶胞的问题


Materials Studio系列教程:

Materials Studio知识点精选第一期

Materials Studio知识点精选第二期

Materials Studio知识点精选第三期

Materials Studio知识点精选第四期

Materials Studio入门到精通[1]:模块介绍

Materials Studio入门到精通[2]:导入晶体结构和调整显示方式

Materials Studio入门到精通[3]:原胞与晶胞的小知识

Materials Studio入门到精通[4]:从无到有建立晶体结构

Materials Studio入门到精通[5]:晶体中的点缺陷:无序固溶体

Materials Studio入门到精通[6]:晶体中的点缺陷:同种原子两种化合态混合

Materials Studio入门到精通[7]:晶体中的点缺陷:空位

Materials Studio入门到精通[8]:晶体中的点缺陷:取代与间隙

作者:Ravi

很高兴见到大家准时来到小MS的课堂,开始我们今天的学习内容,上节课我们说到取代固溶体的问题,并且用一个P原子取代了金刚石中的一个C原子,形成了金刚石半导体的n型掺杂结构。但是课后小伙伴就有这样的问题:一个金刚石晶胞有8个原子,其中1个被取代了,那掺杂的浓度就是12.5%。

但是实际上杂质浓度很少有这么高的,百分之几甚至百分之零点几都已经是比较高的比例了,可不可以在建模过程中减小掺杂浓度呢?这当然是可行的,但是首先要说到一个前提,如果使用比较低的掺杂浓度,会需要比较大的晶胞,这样在后续的计算中会大大增加计算量,占用大量的计算资源。

因此一般情况下,我们都是尽可能用比较小的晶胞来解释掺杂浓度较小的问题,不过,12.5%的浓度的确是比较高,今天我们就首先来解决一下这个问题。实际上我们昨天提到了这个问题的解决方案,就是建立超晶胞(supercell),实际上就是将原本的晶胞扩大若干倍。昨天我们在显示方式中,使得可以显示若干个晶胞,但这只是显示方式的修改,并没有真正将晶胞本身扩展。但是超晶胞(supercell)是对于晶胞本身的扩展,这是两者的本质区别。

超晶胞功能需要先在菜单栏选择Build->Symmetry->Supercell选项,接下来就可以在弹出的对话框中调整三个方向扩展的倍数。例如,我们想要建立2×2×2的超晶胞,在每个方向上扩展2倍,晶胞就会变成原本晶胞的8倍。

Supercell选项我们将A、B、C调整为2,按下Create Supercell按钮,就可以创建超晶胞。可以发现,和昨天仅改变显示方式相比,创建了的超晶胞在内部没有晶格,其实说明了这是一个完整的晶胞。

金刚石2×2×2超晶胞接下来,和之前一样取消结构的对称性(Make P1),选中一个C原子,在菜单栏中Modify->Modify Element->Phosphorus,将这个C原子变成P原子,就得到了掺杂浓度为1.56%的n型掺杂金刚石,这就与实际的掺杂实验更加接近了。(吐槽一句,n型掺杂是掺P,p型掺杂是掺N,真的是搞什么嘛。)

掺杂浓度为1.56%的n型(P)掺杂金刚石接下来就稍微履行一下上次的诺言,我们进行一个简单的算例,对晶体的晶格常数进行预测。说“简单”是因为我们先基本上使用默认参数,先不多说明参数的意义。当然关于参数的意义,我们在之后的教程中会逐渐讲到,另外也可以参考之前的关于CASTEP中参数含义的教程。首先导入一个金刚石晶体模型,并将其变为原胞(从而减少计算量)。接下来在菜单栏中选择Modules->CASTEP->Calculation,打开CASTEP计算面板。

CASTEP计算Setup选项卡中是一些基本设置,我们将计算任务(Task)改成几何优化(Geometry Optimization),精度(Quality)改为Fine,精度需要在Fine以上才可以发文章,但是实际在文章中给出的参数并不是这样,我们之后会说到。对于Metal的勾选,我们这里可以选择,也可以去掉(对于这个问题,在问题选集里有比较详细的说明,一般对于半导体可以不勾选,对于导体勾选)。在选择几何优化任务后,后面的More按钮会变成活动的,这个时候单击More按钮,勾选Optimize Cell选项,对晶胞进行优化。如果不勾选这个选项,对于该计算是无法进行下去的,因为所有原子的位置已经被对称性所固定,能够改变的仅有晶胞参数。

Optimize Cell优化晶胞参数另外,在Properties选项卡中,将所有性质前的对号都去掉(仅进行结构优化,不计算性质)。在Job Control选项卡中,可以增加计算核数,从而提高计算速度。不过我们这个体系仅有两个原子,计算将很快完成。计算时,在Jobs区域会出现关于该计算任务的相关信息。

Jobs区域出现对于任务的描述稍事休息,计算马上完成,小MS也要去休息了。下节课我们将会对计算结果进行简单的分析,大家再见啦。

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