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作者:Ravi
Materials Studio系列教程:
Materials Studio入门到精通[2]:导入晶体结构和调整显示方式
Materials Studio入门到精通[3]:原胞与晶胞的小知识
我是大家的小MS,MS Visualizer中有很多强大的模型搭建和绘图工具,相信这是每一个MS说明书上大家都熟知的内容。另外的教程中,也为大家介绍了如何用MS自带的绘图工具绘制一个苯环,这里也不再为大家赘述。今天我们使用MS的建立晶体工具建立一个ZrO2晶体结构模型(倒带回2天前,旁白:这和之前说的不一样,之前说的是Y0.15Zr0.85O2形式的晶体模型,我要退货!)。Y0.15Zr0.85O2当然是要有的,但是这么复杂的问题我们就留到下次来解决吧。(相信我!)
首先打开MS软件,新建工程,之后在工程区新建一个3D结构文件,只需要右击工程名称,选择New—3D Atomistic Document就可以啦,现在我们就会出现一个新的3D结构文件3D Atomistic.xsd,当然名字可以修改,右键Rename,我们把它的名字改成YSZ好了(钇稳定氧化锆)。
新建3D结构文件
接下来我们就可以先画一个晶格,在Build菜单中选择Crystals—Build Crystal,就可以开始建立晶格。
建立晶格选项
接下来的内容就会涉及到和晶体学相关的知识,点群、空间群、对称要素等等,小MS学晶体学的时候没有认真学习,但是推荐大家可以认真去了解一下这方面的知识,如果看书比较枯燥,也可以去看看相关的MOOC课程,虽然小MS在看了之后还是一头雾水,但是至少知道了那么一点点,比如说七大晶系、230种不同的空间群、简单立方、体心立方、面心立方……什么的。比如P1就是对称性最差的那个结构,没有对称要素的简单三斜晶格结构。我最熟悉的结构也只有面心立方的两个空间群,227号空间群Fd-3m的金刚石结构,以及225号空间群Fm-3m的MgO结构(毕竟做的是在MgO/Ir衬底上异质外延金刚石)。现在我们要建立一个ZrO2晶体(预备Y0.15Zr0.85O2晶体,因此我们按照Y0.15Zr0.85O2晶体晶格常数搭建结构),它属于225号空间群,现在我们在Space Group选项卡中选择225空间群,可以从下方看到其对称性、对称操作和原子位置等信息。
选择空间群接下来我们要在Lattice Parameters选项卡中设置晶格常数,包括晶胞尺寸和夹角,当然所选择的空间群对于这些参数会有一些限制,例如对于225号空间群,由于需要保证a=b=c,α=β=γ=90°,所以实际上只能够调整一个参数,我们将它调整为5.139Å(这个值是从Jade的卡片里找到的Y0.15Zr0.85O1.93的晶格常数,当然晶体数据库应该也有),单击Build,就可以出现我们想要的晶格结构了。
输入晶格常数
就会在显示区出现一个非常醒目的空格子,就是我们将要使用到的晶格。如果有参数输入错误,还是在菜单栏Build—Crystals,但是会发现这时候已经不再是Build Crystal选项,这是因为我们已经有了一个晶格,于是这个选项就变成了Rebuild Crystal,我们可以使用这个选项对空间群、晶格常数等信息进行进一步修改。接下来我们要添加原子,快捷工具栏上的添加原子工具
和菜单栏Build—Add Atoms选项都可以进行这一步操作,我们来添加O原子,在XYZ坐标(0.25,0.75,0.25)位置(这个别问我怎么做到的,我打开了一个ZrO2结构读了它的原子坐标嗯……),以及Zr原子,元素后面的三个点的按钮可以打开元素周期表,选择元素种类,当然一些常见的元素在下拉列表中也会有。选择Zr并添加到坐标(0,0,0)的位置,现在我们就有一个ZrO2的晶体结构了。
添加原子
至此,我们这一次的内容就结束了。下一次我们一定会建立一个Y0.15Zr0.85O2形式的晶体模型的,相信我减肥的诚意。另外还有空位、掺杂、替换等各种操作,请大家一定期待。另外,小MS碎碎念,文件千万记得保存,不要删掉哦,下次我们还需要继续使用。
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