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印第安纳大学丁颖教授团队在2013年曾经提出了“实体计量学”（entitymetrics）的概念。实体计量学提供了一种定量的方法，通过拆分文章成不同级别的实体，来确定究竟是什么因素导致了知识的传播。

编译作者：高正 /Indiana University      原文作者：丁颖 等

素材来源：Plos One                      图文编辑：李江 / 浙江大学

注：图片来源于参考文献中论文

实体计量学的重要性

在科学领域，文章可以作为知识的载体而出现。通过文章间的相互引用，知识才得以发展和传播。然而，知识是抽象地蕴藏在文章当中的，我们很难从字里行间具体地定位。只有从文章中拆分出独立的实体，才能使用每个彼此独立的实体代表一个单独的知识点。这样，每篇文章就表述成一系列实体的累加，而文章间的相互引用也可以转化成实体间的相互引用。在Webof Science 数据库中，存在着几乎所有领域的学术论文，这些文章之间存在着一定的引用关系。对于感兴趣的话题，我们可以得到所有相关的论文和其之间的引用关系。由此，我们可以得到一个文章-文章的引文网络。在本文中作者定义，如果文章A引用了文章B,那么文章A的所有实体会被看作是引用了文章B的所有实体，由此，一个实体-实体的引文网络就得以建立（如下图所示）。通过对实体-实体的引文网络的分析，我们可以定量地计算出哪些实体在网络中起到相对重要的作用。而这些实体，往往对于我们感兴趣的话题也十分重要，从而推动我们发现新的知识。

实体究竟是什么

总体来说，实体可以有两个维度的分类。

横向而言，学术文章的实体可以被分成两类：评论性实体和知识性实体。评论性实体主要是用来衡量学术影响力，对于一篇文章而言，其本身被引用次数、作者、发表期刊乃至所属院校都是文章的评论性实体。通过这些实体，我们可以知道哪些作者被引用次数多、哪些期刊的影响因子大等关键问题，这些都潜移默化地影响着蕴藏于文章中知识的传播过程。毕竟，这些因素决定着文章是否能被更多的学者阅读和了解。知识性实体则是文章知识的载体。文章的关键字、话题、主题类别、所用的数据乃至领域相关的专业词汇都是典型的知识性载体。文章是由文字构成的，这些文字可以直观地反映出文字所要表达的内容和观点。很多科学分析模型（如共词分析）如今已经被广泛应用到探索知识传播的研究分析中去了。更有利的一点是，随着Web of Science等数据库的出现，知识性载体已经能够更加准确地从文献中获得，这使得在未来基于知识性实体的分析将会更加容易。

纵向而言，根据计算粒度的不同，实体还可以被分割成宏观层面实体、中观层面实体和微观层面实体。在实体-实体的引文网络中，评论性实体都属于宏观层面实体，比如文章的作者、所属期刊和被引次数。而知识性实体存在于中观层面实体和微观层面实体之中。文章中的关键词属于中观层面的实体。而文章中所运用的研究方法、研究数据以及其他知识性实体都属于微观层面的实体。

在医学领域的应用

实体计量学可以完美应用到各个领域之中。在本文中，作者列举了一类医学药物Metformin的例子，对比发现实体计量学模型得到的与此药物相关的基因，药物和疾病高度符合CTD（Comparative Toxicogenomics Database）数据库中的已有实验结果。

首先，作者通过PubMed数据库，从3068 种期刊中找到三十多万篇与Metformin相关的文章，其发表时间横跨了1966年到2011年。其次，在这些文章中抓取出所有和医学相关的实体（包括疾病，药物和基因等等），构建出实体-实体引文网络。然后在此引文网络的基础上，计算了不同的网络特征，并且找出了每种特征值最高的实体，与CTD数据库中已有的结果进行比对。实体-实体引文网络的特征分为三个层面：第一，基于整个网络的特征属于宏观层面特征，比如被引次数最多的文章。第二，基于社群的特征属于中观层面特征。根据引文网络的拓扑结构，引文网络中的实体可以被划分成不同的社群，而引文网络的社群聚集系数（clusteringcoefficient）就是典型的中观层面实体。第三，基于个体的特征属于微观层面特征。比如每个实体在引文网络中的出度和入度等等。

根据实验结果来看，作者发现30种基因和metformin（一种抗糖尿病药物）有高度交互作用。其中八种基因符合CTD数据库中相关的医学实验记载，而剩余的22种基因和metformin的紧密联系的原因虽然目前未知，但同时也给我们提供了很好地医学设想，为未来的科学研究和知识发现提供了理论上的依据。

Ding, Y.,Song, M., Han, J., Yu, Q., Yan, E., Lin, L.,& Chambers, T. (2013).Entitymetrics: Measuring the impact of entities. PloSONE, 8(8), e71416.