Statistical Analysis of the Benefits of Focused Saturation Mutagenesis in Directed Evolution Based on Reduced Amino Acid Alphabets

基于约化氨基酸字母表的定向进化中聚焦饱和突变效益的统计分析

来源：ACS catalysis

IF：12.350

摘要：定向进化技术是改造酶催化特性（如立体/区域/化学选择性、活性、热稳定性等）的有效手段。前期研究证明，对位于酶催化口袋的氨基酸残基进行饱和突变（SM）可成功控制酶的选择性和活性。作为常用的简并密码子，NNK可编码20种氨基酸，但随着突变位点的增多，筛选量呈指数级增长（20m，m为位点数目）。如何通过精简密码子设计并构建高效突变体文库？从而克服筛选瓶颈受到越来越多的关注。 约化字母表：理论上可以将具有相似生化性质和频率分布的20种天然氨基酸组成的字母表压缩为由更少氨基酸类别组成的约化氨基酸字母表，进而简化蛋白质序列和结构分析。