Highly active enzymes by automated combinatorial backbone assembly and sequence design

自动组合主链和序列设计高活性的酶

文章来源Nature communications

IF：11.878

摘要：具有天然催化性能的酶的自动化设计一直是一个长期而难以实现的目标。在这里，我们提出了一个通用的，自动化的方法，通过自动组装蛋白质主链进行蛋白质设计。该方法从一组同源但结构多样的酶结构出发，利用Rosetta优化氨基酸序列，在保留关键的催化残基的基础上进行主链的自动组装。我们将此方法应用于两个不相关的具有TIM-barrel折叠的酶家族:糖苷水解酶10 (GH10)木聚糖酶和磷酸三脂内酯酶（PLLS），分别设计了43个和34个蛋白质。高活性GH10突变体的原子精度通过晶体学分析得到进一步证实。因此，主链组装和设计可用于生产稳定的、高活性的和结构多样化的酶。