Discovery of processive catalysis by an exo-hydrolase with a pocket-shaped active site 

一种具有囊状活性口袋的外切水解酶催化过程的发现 

来源：Nature Communications

IF：12.353

摘要：底物结合和产物迅速从酶催化位点分离，这妨碍了对其轨迹的研究。从大麦幼苗中分离得到的天然外切水解酶HvExoI的高分辨率结构表明，非共价捕获的葡萄糖形成稳定的酶产物复合物。在这里，我们报告了以晶体HvExoI灌注的烷基β-d-葡萄糖苷和甲基6-硫-β-龙胆糖苷底物类似物在取代葡萄糖后在催化部位结合，而甲基2-硫-β-槐甙在附近附着。HvExoI中纳米级反应物运动的结构分析和多尺度分子模拟表明，当进入底物产生结合时，葡萄糖产物改变其结合模式，并诱发形成一个短暂的侧腔，该侧腔是葡萄糖的通道，以便进行下一轮催化。这条路径使底物产品辅助加工催化多种水解，而HvExoI不会失去与低聚物或聚合物底物的接触。我们预计，这种酶的催化特性可能是在外切水解酶中普遍存在的。