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关于microRNA的命名规则:
(1) miRNA 简写成miR,再根据其被克隆的先后顺序加上阿拉伯数字,如miR-21;
(2) 高度同源的miRNA 在数字后加上英文小写字母(a、b 、c),如miR-199a 和miR-199b;
(3) 由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA,则在后面加上阿拉伯数字以区分, 如miR-199a-1 和miR-199a-2;
(4) 如果一个前体的2 个臂分别加工产生miRNA,则根据克隆实验,在表达水平较低的miRNA 后面加“*”,如miR-199a和miR-199a*,或进行如下命名,miR-142-5p(也可命名为miR-142-s,表示从5' 端的臂加工而来)和miR-142-3p(也可命名为miR-142-as,表示从3′端的臂加工而来);
(5) 将物种缩写置于miRNA 之前,如hsa-miR-195 ;
(6) 确定命名规则之前发现的miRNA,如let-7,则保留原来名字。
(引自周凡,庄诗美.《microRNA与肿瘤》, 生命科学, 2008, 20(2):207-212. )
以上有误或不完整,进一步纠正或说明一下:miRNA前体两臂上产生的两个miRNA,研究者将丰度较低的miRNA加以“*”标记,而当前未通过实验确定丰度高低的,以诸如miR-142-5p(5‘臂)和miR-142-3p(3‘臂)这种命名形式来区分。
另外,推荐一本miRNA研究的经典数据:
《microRNA鉴定与功能技术》
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GMT+8, 2024-12-25 16:22
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