||
1.http://www.detaibio.com/tools/
虽然名气不大,但功能很强大。
2.http://www.kazusa.or.jp/codon/
这是日本一个专门的密码子数据库,在里面先输入你要表达的动物的名称,就可以得到关于这个哺乳动物表达系统的密码子偏爱性表,然后把氨基酸序列翻译成相应的偏爱密码子就可以了!
3.https://www.vectorbuilder.cn/tool/codon-optimization.html
利用Codon
W可以对基因的RSCU,CAI,Fop和Nc等指标进行分析。
由于单个软件都会有其长处和短处,最好的办法是使用多个优化软件分别进行优化,然后使用软件计算优化后基因的适应度值(CAI,codon
adaptation idex)。切莫只依靠单一的软件优化结果。
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2024-11-28 06:30
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社